Chenxiaona

Results 5 issues of Chenxiaona

老师,就是如果我跑ML树的话,就是在ModelFinder中建模型的时候,model for 那里我要选择PhyML对吧? 然后再把ModelFinder_results导入import to IQ-TREE,最后跑出来的树就是ML树对吧?

老师,关于以下存储空间不足和字符报错一般怎么解决? Division 1 has 708 unique site patterns Initializing conditional likelihoods Using standard non-SSE likelihood calculator for division 1 (single-precision) Out of memory. Most probable cause for the problem is...

老师,您好。对序列进行比对时出现了以下问题,这里报错的意思时序列里面含有特殊字符吗?我检查了所有序列,里面没有特殊字符,对于这种情况,我应该如何解决这个问题? 还有,如果没有解决以下报错问题的话,我把这些序列在其他软件(geneious)进行比对后,再到phylosuite跑树的话还会报错吗? Gap Penalty = -1.53, +0.00, +0.00 === Alphabet 'i' is unknown. === Please check site 1 in sequence 9497. === To make an alignment that has unusual characters...

老师,又来打扰您啦。就是我在跑树的时候出现了以下报错: **Taxon name** AB614504_1_Phyllocnistis_gracilistylella_mitochondrial_COI_gene_for_cytochrome_oxidase_subunit_I__partial_cds__country__Japan_Nagano__Nagano__Sai_gawa is too long. Maximun 99 characters is allowed. 由于我的序列较多,许多Taxon name的字符也很长,因此,我想问问老师有没有什么办法可以批量的将‘Taxon name'批量更改为只保留序列的序列号/登录号,而序列号/登录号后面的描述删除呢? 也给出了相对应的解决方案: 1.Deleting previously defined characters 2.Deleting previously defined taxa 还有以下的提示 Returning execution to command line......

1.老师您好。想问一下,就是将比对好的序列在PhyloSuit Viewer界面打开后,序列的某些部分是.......(点点点),这代表什么意思?是没有序列的意思吗?没有有序列的区域因该显示的是------这些符号吧? 2.还有没有序列的区域,在最上方的*****这些符号又是什么意思呢?