Suns

Hi, I used torchsample to train the model. However, when I used Adam as the optimizer with 1e-4 learning rate, I found the ReduceLROnPlateau callback seemed not work. I checked...

**在使用FAE进行自己的课题研究室，建议请先根据[FAE视频](https://www.bilibili.com/video/BV1yt4y1S79S/)运行Demo数据，将程序测试之后，再进行自己数据的研究。** ## 特征提取 1. **FAE能否提取hdr/img格式的数据？** A: FAE进行特征提取时是基于pyradiomics 3.0。因此能否提取取决于PyRadiomics是否支持。可以通过Slicer等软件将hdr/img转成nii使用FAE提取，或直接使用其他软件（如Slicer）进行特征提取，再使用FAE对特征矩阵进行分析。 1. **数据清洗界面中的Random Split和test-ref Split的区别是什么？** A: 详情可以参照[FAE视频](https://www.bilibili.com/video/BV1yt4y1S79S/)，P3的4:08部分。这里大概说明一下，Random Split是随机拆分，Test-ref是根据已拆分好的矩阵，进行相同Case的拆分。比如说我们有100个人的T2像，提取特征，进行了8:2的Random split，然后建模分析。后面我们又提取了T1像，想看看T1的特征在相同训练集和测试集上的表现怎么样，这时候可以使用test-ref split，此时只需要导入上一步拆分好的测试特征矩阵文件。 1. ~~**ROI文件的label，用的不是1存储，而是其他数值，应如何使用FAE进行提取？** A: 基于PyRadiomics，可以修改配置文件中的label属性，进行对应ROI的特征提取。但由于目前版本中的FAE会重写配置文件，因此这个功能无法实现，还需要工科人员通过PyRadiomics的库进行提取。下一版本会改善此功能。~~ (v 0.3.7) 1. **如何检查图像和ROI是否一致？** A: 可以使用ITK-SNAP或者其他软件，观察图像的大小、分辨率、方向等信息，与ROI是否一致。例如有进行超声数据分析时，有图像为200x200，ROI为200x200x1，此使图像和ROI不匹配。 ## 数据预处理 1....

the hyper-parameters can be explored according to the JSON files. There should be UI for the hyper-parameter tuning to make one use FAE conveniently.

Allow FAE to build the mode with - [ ] Multi-classification - [ ] Survival analysis

For the clinical features, there are some categorical variables, such as tumor stage and gender. There should be some function to help preprocess these categorical variables in the Data Preparation.

BraTS是脑部的数据集，或许应该分类在脑下面？

另: 项目fork之后无法直接运行, 需将metrics.md命名为metrices.md 将utils.md中一些三级标题改为二级标题, 以便从目录中可以进行检索.