Liu Ninghua

如何调整Biomarker可视化过程中，显示label的数量

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老师好，我想知道在这一步该怎么调整label的数量，调整成显示丰度前10的门，其余可以合并为other之类的显示格式 # display the high light of phylum clade. p2

mp_plot_abundance()功能X轴样本排序

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老师好，新版的物种组成可视化函数中，没有了旧版的sampleLevels参数，该如何设置X轴的样本顺序呢？我没有找到可以为它设置因子顺序的方法，麻烦老师解疑一下，谢谢老师。

将phyloseq转换为mp遇到问题

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老师好，我想使用自带的mp_plot_abundance对自己的数据进行可视化。我有一份tax数据和一份otu数据，将它们转换为phyloseq格式后，使用as.MPSE()进行转换，可是出现了报错提示：**Warning message: The taxonomy class can not be converted to treedata class. Please check format of taxonomy class is corrected, for example, whether the order is from Kingdom, Phylum, Class,...

mp_plot_abundance函数调整X轴样本顺序

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老师好，我想调整物种组成图上X轴的样本顺序，我通过mpse2@colData$group

ggordpoint()如何更改置信椭圆的线条粗细？

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老师好，我想知道如何更改置信椭圆的线条粗细。 我根据教程进行PCOA分析，可视化pcoares对象，但ggordpoint()貌似没有这个参数；我想使用yyplot中的的geom_ord_ellipse函数，但是我不知道如何将geom_ord_ellipse图层添加到pcoaplot上。麻烦老师解答。谢谢老师！