huizhang
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尊敬的张博士: 您好! 这篇论文我仔细研读了,但还有些具体地方没有弄明白,所以来请教。 问题1:点嵌入、点属性具体是指是什么?我查了一下资料,我的理解就是图中节点的向量表示,这里不知道是不是,节点属性是 度 吗 问题2:信息矩阵X的构建,论文说是向量连接起来,具体是怎么连接的呢?可以用图的方式说明一下吗?或者就以矩阵表示,信息矩阵X每行代表什么,每列代表什么? 问题3:f(A,X),(A,X)是不是这两个矩阵的拼接作为输入,最后的输出结果是带标签的0或者1,以表示中心节点对(x,y)是否存在链接?
How to output the feature of the last layer of the neural network of each graph in the list of graphs to be tested ?
Hello, how do you output the predicted label and probability value at the end of the code?
博主你好,文章的数据集是直接使用的original data文件下的数据吗?如果是的话,那TF是不是基因表达数据矩阵的前面行数,例如,In Silico 数据集总共有1643个节点,Samples 805,那么基因表达数据矩阵M的shape就是(1643×805),而In Silico 数据集的TF 有195个,Target Genes 有1448 个,在M中,前195行是不是就是TF?我在training data文件夹下(net1_expression_data.tsv)查看到的Silico基因表达数据矩阵是把基因第一行按G1到G1643 进行编码排序,training data文件夹下(net1_transcription_factors.tsv)文件,则指G1到G195是TF(转录因子基因)。original data文件下则没有说明。