Raku Son

Results 11 comments of Raku Son

@map2085 @hd00ljy Hi, I'm having the same problem with you. Did you find any way around?

@hd00ljy Thank you so much for the information. I will give it a try!

@brentp @arq5x I think we want something like 1,064,643 (instead of 1.06464e+06). (I also had similar problems mentioned [here](#1015) By the way in a different situation when I perform `bedtools...

Thank you so much for your response!

@brentp Thank you so much for your prompt response. I checked it but somehow still found "e"... Is it because I'm applying -5 options? `./bedtools.static genomecov -ibam input.bam -5 -bg...

@brentp @arq5x Thank you so much for following up. It would be really nice if we can choose to output integer as in "precision(0)".

@brentp I tested it and it worked perfect! Thank you so much for your quick solution. `./bedtools.static genomecov -ibam input.bam -5 -bg -strand + > output.bedGraph` `grep "65499044" output.bedGraph` `chr11...

Hi, I encountered the same error with `Seurat` v5.1.0, `SeuratObject` v5.0.2 and `Matrix` 1.6.4. Does anyone solve the problem?

はじめまして、同じところで困っております。こちら解決されましたでしょうか…?

ご連絡いただきありがとうございます。完全にプログラミング初心者なので意味を解釈できていないのですが、下記の作業で一旦解消したようです。いかがでしょうか。 https://ncbi.github.io/sra-tools/install_config.html こちらに沿って $ vdb-config --interactive を実行し、C (CACHE)から空のローカルのディレクトリを指定するも繰り返し同じメッセージが出てしまったため、 https://www.cnblogs.com/zypiner/p/13187648.html こちらを拝見して $ ./sratoolkit.2.10.8-mac64/bin/vdb-config --interactive と直接指定して同様の作業を実行 こちらのあとに再度 $ ./040_run-sra-fastq-dump.sh としたところ Read 57442589 spots for DRR006760.sra Written 57442589 spots for DRR006760.sra と表示されたのですがこれは問題なく進んだということでしょうか。