Shujia Huang

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> 树嘉大大您好: > 我是中山大学的在读博士liyt,关注您的公众号一段时间,作为生信小白,最近见您发表了ilus工具,立刻想研究学习,已按照您的yaml模板和fastq.list模板改写了本地模板(因上传的原因将文件后缀改为.txt),见附件,并在windows10的WSL下的conda环境下试运行,输出“** WGS done, 0 seconds elapsed **”,但没有运行程序,我不知道原因为何,想向您请假。第一次在github提iusse,还请多多指教,谢谢。 > ![命令行](https://user-images.githubusercontent.com/54201517/127771490-5f70fde7-72c4-451f-9d61-530e0d4fa9de.JPG) > [Input.txt](https://github.com/ShujiaHuang/ilus/files/6912697/Input.txt) > [ilus_HGDP_210801.txt](https://github.com/ShujiaHuang/ilus/files/6912691/ilus_HGDP_210801.txt) > > Email: [[email protected]](mailto:[email protected]) ilus 不会主动运行你的任务的,只生成整个流程的执行脚本,你在 00.shell 目录下可以看到对应步骤的shell bash脚本,从 step1到step6,你按顺序投递这些任务就可以了,这个我在原来的公众号文章也有详细描述。

PU 是测序数据的一个唯一标识,可以起到区分不同测序lane的作用,它一般可以用 FollowCell 的编号信息+lane 信息+样本barcode或者样本ID。最好是有,一般在测序下机数据的命名里面可以看出来,如果实在没有,那也可以自己为每一个lane的测序数据编一个唯一的编码。