Shixiang Wang (王诗翔)
Shixiang Wang (王诗翔)
> 假如要用ANCOVA的话，协变量要写在自变量的前面，之前是我说错了 > 我们除了TUBB1以外，还有可以测试的基因和药物么？ 不知道呢。我昨天查了下紫杉醇的工作机制如 haitao 所言，不确定该药是否影响 TUBB1 的表达。另外，我仔细检查数据后发现横坐标计算的 effect 在不同组织中差别很大，所以如果要提供该分析结果，**最好还是以某个组织而不是泛癌的结果**，泛癌的结果并不一定具备参考性。
从分析逻辑和目前的结果来看，都还是需要修改的，不能将误导性结果放到 Shiny 中去。
@all 为了进行常规的维护，我会对该项目创建以2个月左右为周期的milestone，一些issue将会被分配进去（例如本issue分配到2021-09，即在9月底前完成）。大家一起在周期内讨论和解决相关问题。 感谢大家的参与，希望未来几天可以收到文章接收消息 :)
可以考虑使用 https://github.com/XiaoLuo-boy/ggheatmap 可视化
https://github.com/stemangiola/tidyHeatmap 底层是complexheatmap，使用应该会容易点
https://glin.github.io/reactable/articles/examples.html#shiny 可以辅助展示
- https://waldronlab.io/cBioPortalData/articles/cBioPortalRClient.html - https://cbioportal.github.io/2020-cbioportal-r-workshop/
cBioPortal的数据是以Study为基础，需要新型的表格展示形式 
把数据整个下载再导入操作感觉更方便点： ```r library(cBioPortalData) studies
@LongpanUPC Thanks. I basically don't modify any code regarding the computation. Could you share the ABSOLUTE version and source you used? Go further, if you have more time, could you...