Liny2333
Liny2333
And the error is Error in CMplot(data2, plot.type = "c", r = 0.4, col = c("grey30", "grey60"), : p values should be at range of (0, 1).
I also try to use the other data which without a p-value of zero and i 've got the plot.How can I use data with a value of 0 to...
你好请问你找到解决方法了吗?我也遇到了一样的问题,我的目的是画环形曼哈顿图,我发现是因为我的p值存在0的值就会报错,但是我的数据不能删除那些0值。
> 你好,统计检验的P值理论上不可等于0,如果不是P值,存在0的情况,可以添加参数LOG10=FALSE;如果是P值,需要弄清楚出现0的原因,针对具体情况调整数据 你好,感谢你的回复,我也意识到了这一点,但是我的数据是p值和fst值,这两个轨道的其中一个需要添加参数LOG10=FALSE,而另一个不需要,我就不知道怎么设置了。
> @Liny2333 可以先把数据进行转换,比如把p值提前用-log10转换好,然后再把替换好的数据赋值给CMplot,并设置参数LOG10=FALSE即可实现。 谢谢,太有帮助了!!