Guangchuang Yu

treeplot update

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看了一下例子，觉得既然是画cladogram，那么highlight的时候，如果align更好看，让@xiangpin 搞了，那么treeplot需要相应地更新，可以用这个参数。 ，至于compareCluster的支持，饼图在这里实在是鸡肋，可以保留这个功能，但默认不应该是这样的形式呈现，饼图大了overlap，小了没法看，就是能看的时候，辨识起来也不行。应该画一个heatmap或dotplot来表示归属，还可以用比如p.adjust，各自填充颜色等。

我试了一下： ```r dotplot(edo, showCategory=20, orderBy='pvalue') + geom_path(aes(GeneRatio, Description), group=1, size=.3, colour='steelblue') + coord_polar(theta='y') ``` 得到这样的图：  现在dotplot画compareClusterResult是好像画heatmap那样，我觉得可以像画enrichResult一样，但点会混在一起嘛，所以用连线不同颜色来代表不同的clusters，以这样的形式也可以，写一个dotplot2。 然后这个只要转换为极坐标，就可以如radar plot一般。

latex formula embeded

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Is it possible to label the text with latex formula?

color theme

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Thank you for developing this hugo theme. Is it possible to support color theme similar to [hyde-x](https://github.com/zyro/hyde-x#built-in-colour-themes)?

 see also

image legend key

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```r #!/bin/env Rscript library(ggimage) set.seed(2018-12-11) d 5, 'pikachu', 'tauros'))) windows() options(ggimage.keytype = "rect") ggplot(d, aes(x, y, colour=type, angle=angle)) + geom_pokemon(aes(image=ifelse(x>5, 'pikachu', 'tauros'))) windows() options(ggimage.keytype = "image") ggplot(d, aes(x, y, colour=type,...

extract coordinations to update image positions, .

TODO

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+ [ ] support setting color and alpha in aes()

Bioconductor support

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Someone reports a Windows specific issue of my Bioconductor package to me and I don't have Windows machine. I use `check_on_windows` to test it and it throw error for dependencies...