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三倍体基因组
老师,您好 三倍体基因组划分成这样了,单套17条,还能有改善吗
这是没分开,如果组装没问题,就很难再改善了,有可能是同源三倍体,用这个方法分不开。如果可用kmer很少,可以试试减少配置文件里的同源关系(原先17行3列改成比如10行3列+21行1列的),并降低-q参数(比如降到100)。
老师,您好 三倍体基因组划分成这样了,单套17条,还能有改善吗
这是没分开,如果组装没问题,就很难再改善了,有可能是同源三倍体,用这个方法分不开。如果可用kmer很少,可以试试减少配置文件里的同源关系(原先17行3列改成比如10行3列+21行1列的),并降低-q参数(比如降到100)。