根据issue16的方法调整后mac仍无法归档草稿

[EvaAphelios]

Environment

1. Vault template release version: v1.7
2. Operating system: macOS Monterey 12.3.1
3. Python version: 3.9.12 (anaconda)
4. Zotero version: 6.0.7
5. Pandoc version: 2.18
6. Obsidian version: 0.14.6

Bug description

obsidian中的准备：front matter中每一项我已确保填上，destination格式确保无误（无论是03-98还是03-Projects/自建项目A都尝试过），状态改为了complete； python方面的准备：检查usr/bin发现文件叫做python3，于是按照issue16（good issue）中用户liuxiao916的方案调整，第一种方案：终端输入指令sudo ln -s /usr/bin/python3 /usr/bin/python后需要输入电脑密码，而后显示operation not permitted；改用第二种方案：在设置中将templater插件的user function的各个指令中的python替换为python3，多次尝试（包括重启后）都没有成功使得草稿归档。 您的模板库开发得非常棒！我想长期使用，但是关于python这里遇到的问题，还希望您能拨冗解决一下！十分感谢！

Obsidian console information

console显示 VM126:15960 QuickAdd: (LOG) TemplaterError: Error with User Template auto_transfer

[sheldonxxd]

刚为常用的若干功能新增了几个按钮（见右侧边栏），通过 shell commands 插件调用 python 代码，应该具有更好的多平台适应性。 git clone 后可自行尝试修改该插件设置：

[sheldonxxd]

先需要确保你自己打开的 terminal 能够运行 python（anaconda）。

[EvaAphelios]

刚为常用的若干功能新增了几个按钮（见右侧边栏），通过 shell commands 插件调用 python 代码，应该具有更好的多平台适应性。 git clone 后可自行尝试修改该插件设置：

刚按照您的指示，在shell commands插件界面的草稿归档处选择了小按键“execute now”，随后在我想要归档的草稿行文处显示zsh:1: command not found: python；而后我考虑到是不是我的文件叫python3的原因，于是将shell commands中python改为python3，而后显示↓ Traceback (most recent call last): File "./08-Assets/Scripts/auto_transfer.py", line 3, in from obs import Obsidian File "/Users/略去我的名字/Library/Mobile Documents/iCloud~md~obsidian/Documents/Research Vault/08-Assets/Scripts/obs.py", line 2, in import bibtexparser ModuleNotFoundError: No module named 'bibtexparser'

然而关于bibtexparser，我根据您的使用指南在第一部分软件安装的时候就已经安装过了，如下： Requirement already satisfied: pyperclip in ./opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages (1.8.2) Requirement already satisfied: bibtexparser in ./opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages (1.2.0) Requirement already satisfied: future>=0.16.0 in ./opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages (from bibtexparser) (0.18.2) Requirement already satisfied: pyparsing>=2.0.3 in ./opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages (from bibtexparser) (3.0.4)

此外，您提及先需要确保自己打开的 terminal 能够运行 python（anaconda）；在这一方面我确实是第一次接触python不太了解，之前安装anaconda后运行python --version确实能跳转出版本信息，双击anaconda navigator也能成功打开界面，您觉得这样子的功能验证够吗？还是我需要进行别的验证方法？

再次感谢您的回答！

[yangjiming93]

和你遇到相同的问题

[chengsonghust]

Obsidian启动时会覆盖环境变量PATH，默认启动/usr/bin路径下的python和python3。因为Mac很多底层库调用的都是/usr/bin路径下的python，不建议直接用超链接覆盖，可能会系统程序导致版本错误。建议使用绝对路径指定调用的python。例如：/opt/homebrew/bin/python /Users/xx/opt/miniconda3/envs/pytorch/bin/python。

[yangjiming93]

Obsidian启动时会覆盖环境变量PATH，默认启动/usr/bin路径下的python和python3。因为Mac很多底层库调用的都是/usr/bin路径下的python，不建议直接用超链接覆盖，可能会系统程序导致版本错误。建议使用绝对路径指定调用的python。例如：/opt/homebrew/bin/python /Users/cs/opt/miniconda3/envs/pytorch/bin/python。

根据你的提示，Command Shell 可以调用Python脚本了，但是QuickAdd 草稿归档无反应，是需要改Templater吗？

[yangjiming93]

Obsidian启动时会覆盖环境变量PATH，默认启动/usr/bin路径下的python和python3。因为Mac很多底层库调用的都是/usr/bin路径下的python，不建议直接用超链接覆盖，可能会系统程序导致版本错误。建议使用绝对路径指定调用的python。例如：/opt/homebrew/bin/python /Users/cs/opt/miniconda3/envs/pytorch/bin/python。

没事了！我自己又重新设置了QuickAdd，问题已解决

[EvaAphelios]

Obsidian启动时会覆盖环境变量PATH，默认启动/usr/bin路径下的python和python3。因为Mac很多底层库调用的都是/usr/bin路径下的python，不建议直接用超链接覆盖，可能会系统程序导致版本错误。建议使用绝对路径指定调用的python。例如：/opt/homebrew/bin/python /Users/cs/opt/miniconda3/envs/pytorch/bin/python。

没事了！我自己又重新设置了QuickAdd，问题已解决

您好，请问您是如何最终解决的呢？

[yangjiming93]

Obsidian启动时会覆盖环境变量PATH，默认启动/usr/bin路径下的python和python3。因为Mac很多底层库调用的都是/usr/bin路径下的python，不建议直接用超链接覆盖，可能会系统程序导致版本错误。建议使用绝对路径指定调用的python。例如：/opt/homebrew/bin/python /Users/cs/opt/miniconda3/envs/pytorch/bin/python。

没事了！我自己又重新设置了QuickAdd，问题已解决

您好，请问您是如何最终解决的呢？

使用python，而不是python3 解决办法

1. Terminal- which python
   1. /opt/anaconda3/bin/python
2. Obsidian 插件 Shell Command
   1. python xxx改为/opt/anaconda3/bin/python ./08-Assets/Scripts/auto_transfer.py 3.文件complete, destination 等信息设置好后，调用Shell Command 草稿归档

希望能帮助到你

[EvaAphelios]

@yangjiming93 成功了！感谢您，也感谢楼里所有其他答主~

[ambition88]

Obsidian启动时会覆盖环境变量PATH，默认启动/usr/bin路径下的python和python3。因为Mac很多底层库调用的都是/usr/bin路径下的python，不建议直接用超链接覆盖，可能会系统程序导致版本错误。建议使用绝对路径指定调用的python。例如：/opt/homebrew/bin/python /Users/cs/opt/miniconda3/envs/pytorch/bin/python。

没事了！我自己又重新设置了QuickAdd，问题已解决

您好，请问您是如何最终解决的呢？

使用python，而不是python3 解决办法

1. Terminal- which python

   1. /opt/anaconda3/bin/python

2. Obsidian 插件 Shell Command

   1. python xxx改为/opt/anaconda3/bin/python ./08-Assets/Scripts/auto_transfer.py 3.文件complete, destination 等信息设置好后，调用Shell Command 草稿归档

希望能帮助到你

请问第一条terminal是在哪里？第二条wwwindows用户可以这样修改吗，我也是ModuleNotFoundError: No module named 'bibtexparser'

[EvaAphelios]

@ambition88 terminal就是终端；我操作系统是mac不太了解，抱歉orz

[ambition88]

@ambition88 terminal就是终端；我操作系统是mac不太了解，抱歉orz

好的谢谢你

[heitanzi]

@ambition88 terminal就是终端；我操作系统是mac不太了解，抱歉orz

您好请问怎么确保自己的anaconda能运行呀，以及我该怎么知道它的绝对路径呀

[Lenthking]

我检查了auto_transfer.py代码，发现第39行的base = os.path.join(rootdir , target)无法得到需要迁移的地址，将其修改成base = rootdit + target，解决了问题

[Lenthking]

我是M1 Mac，系统版本12.5，用的是anaconda提供的python

[thormaxx]

你好，我的系统是win10，Python来自anaconda，单独运行auto_tranfer.py可顺利归档，在obsidian中通过quickadd执行“草稿归档”无反应，感觉像是未能顺利调用py文件；右侧按钮点击无反应，提示没在编辑模式，但我确实是在编辑模式下，请指教，谢谢

[Sakurakdx]

你好，我的系统是win10，Python来自anaconda，单独运行auto_tranfer.py可顺利归档，在obsidian中通过quickadd执行“草稿归档”无反应，感觉像是未能顺利调用py文件；右侧按钮点击无反应，提示没在编辑模式，但我确实是在编辑模式下，请指教，谢谢

我也遇到了同样的问题，请问解决了么？

[OMGljy]

Obsidian启动时会覆盖环境变量PATH，默认启动/usr/bin路径下的python和python3。因为Mac很多底层库调用的都是/usr/bin路径下的python，不建议直接用超链接覆盖，可能会系统程序导致版本错误。建议使用绝对路径指定调用的python。例如：/opt/homebrew/bin/python /Users/cs/opt/miniconda3/envs/pytorch/bin/python。

没事了！我自己又重新设置了QuickAdd，问题已解决

您好，我的系统环境和您的非常相似，十分想请教一下，您知道目前的模板在MacBook如何正常使用”项目归档“功能吗？我尝试使用shell command，但是不知道如何设置！templater基本没用，只能尝试用shell command解决

[thormaxx]

你好，我的系统是win10，Python来自anaconda，单独运行auto_tranfer.py可顺利归档，在obsidian中通过quickadd执行“草稿归档”无反应，感觉像是未能顺利调用py文件；右侧按钮点击无反应，提示没在编辑模式，但我确实是在编辑模式下，请指教，谢谢

我也遇到了同样的问题，请问解决了么？

认命了，选择直接在obsidian外手动运行py文件了

[Amoseriy]

如果你安装了windows的terminal终端软件会出现这样的问题，在cmd中安装了bibtexparser模块，但是在obsidian里面运行会提示这个模块不存在。解决方法是进入vault/08-assets/Scripts文件夹，然后shift + 鼠标右键，在终端中打开，运行python auto_transfer.py，就会报模块不存在的错误，然后用pip进行模块安装即可解决问题。

[Sakurakdx]

我使用Onedrive共享的文件夹，当我全部缓存到本地时，也解决了这个问题

[geyuanyu2018]

如果你安装了windows的terminal终端软件会出现这样的问题，在cmd中安装了bibtexparser模块，但是在obsidian里面运行会提示这个模块不存在。解决方法是进入vault/08-assets/Scripts文件夹，然后shift + 鼠标右键，在终端中打开，运行python auto_transfer.py，就会报模块不存在的错误，然后用pip进行模块安装即可解决问题。

确实是调用到最后找不到模块。

1. Win + R 打开运行窗口，输入cmd回车，打开命令行窗口
2. 找到pip安装路径。Python2/Python3安装路径是相同的，都在x:\Python xx\Scripts路径下
3. 拖动pip主应用程序到命令行窗口
4. 输入“install + 模块/包名”，注意中间要有空格。然后回车。窗口中会显示下载信息。（pip install pyperclip bibtexparser）
5. 问题搞定

[lvl17]

你好，我的系统是win10，Python来自anaconda，单独运行auto_tranfer.py可顺利归档，在obsidian中通过quickadd执行“草稿归档”无反应，感觉像是未能顺利调用py文件；右侧按钮点击无反应，提示没在编辑模式，但我确实是在编辑模式下，请指教，谢谢

我也遇到了相同的问题，请问有人知道怎么解决吗？

[binbinZhao2017]

Obsidian启动时会覆盖环境变量PATH，默认启动/usr/bin路径下的python和python3。因为Mac很多底层库调用的都是/usr/bin路径下的python，不建议直接用超链接覆盖，可能会系统程序导致版本错误。建议使用绝对路径指定调用的python。例如：/opt/homebrew/bin/python /Users/cs/opt/miniconda3/envs/pytorch/bin/python。

没事了！我自己又重新设置了QuickAdd，问题已解决

您好，请问您是如何最终解决的呢？

使用python，而不是python3 解决办法

1. Terminal- which python

   1. /opt/anaconda3/bin/python

2. Obsidian 插件 Shell Command

   1. python xxx改为/opt/anaconda3/bin/python ./08-Assets/Scripts/auto_transfer.py 3.文件complete, destination 等信息设置好后，调用Shell Command 草稿归档

希望能帮助到你

解决了，非常感谢