tommoの変換について

[hiro8956]

勉強させていただきありがとうございます。

tommoのindelのデータをgenericdb形式に変換する件ですが、例えばGATがGに変わっているバリアントの場合、スクリプトを用いて変換した後のgenericdbファイルの中身はGAT→Gとなっているのですが、annovarではAT→-に対して、annotationされるためううまくannotationされないのですが、何か対処法はございますでしょうか。 ご教授いただけましたら幸いです。