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使用jupyter 绘图会出现注释对不齐热图的情况

Open GoBinn opened this issue 7 months ago • 5 comments

通过vscode 下的jupyter,运行绘图函数 visCluster(object = st.data, plot.type = "both", column_names_rot = 45, show_row_dend = F, markGenes = markGenes, markGenes.side = "left", annoTerm.data = enrich, line.side = "left", cluster.order = c(1:7), go.col = rep(jjAnno::useMyCol("stallion",n = 7),each = 5), add.bar = T) 会出现下面的问题 Image

在终端用脚本运行是没问题的!找了好几天了 没找到原因,希望有遇到过这种情况的并解决了的帮忙解答,感谢!

GoBinn avatar Jun 12 '25 09:06 GoBinn

我也一样, 左右注释都没对齐

HUI950319 avatar Jun 27 '25 12:06 HUI950319

软件里面看是这样的结果。建议使用pdf函数保存为pdf文件再打开就没问题了。

junjunlab avatar Jun 30 '25 01:06 junjunlab

我也遇到了相同的问题,用PDF保存再打开依然没对齐。

SleepyClown avatar Jul 03 '25 03:07 SleepyClown

jupyter没试过,rstudio里pdf函数保存应该是没有问题的,可以试试看。

junjunlab avatar Jul 03 '25 13:07 junjunlab

试了各种方法,png,svg,Cairo pdf,在jupyter里保存全部都错位,左右的图没有展开,不知原因 如果相对齐,只能缩减高度,但是右边的条目部分被覆盖

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cmubioinformatics avatar Aug 25 '25 22:08 cmubioinformatics