使用jupyter 绘图会出现注释对不齐热图的情况
通过vscode 下的jupyter,运行绘图函数
visCluster(object = st.data, plot.type = "both", column_names_rot = 45, show_row_dend = F, markGenes = markGenes, markGenes.side = "left", annoTerm.data = enrich, line.side = "left", cluster.order = c(1:7), go.col = rep(jjAnno::useMyCol("stallion",n = 7),each = 5), add.bar = T)
会出现下面的问题
在终端用脚本运行是没问题的!找了好几天了 没找到原因,希望有遇到过这种情况的并解决了的帮忙解答,感谢!
我也一样, 左右注释都没对齐
软件里面看是这样的结果。建议使用pdf函数保存为pdf文件再打开就没问题了。
我也遇到了相同的问题,用PDF保存再打开依然没对齐。
jupyter没试过,rstudio里pdf函数保存应该是没有问题的,可以试试看。
试了各种方法,png,svg,Cairo pdf,在jupyter里保存全部都错位,左右的图没有展开,不知原因 如果相对齐,只能缩减高度,但是右边的条目部分被覆盖