ms3 icon indicating copy to clipboard operation
ms3 copied to clipboard

Warnings of pandas 2.1.0 [BUG]

Open johentsch opened this issue 10 months ago • 0 comments

Once again annoying warnings by annoying changes to the pandas library. Found when performing ms3 review -M -N -X -F -D -c v1.0 on https://github.com/DCMLab/wagner_overtures/commit/7a6f63e50829fa73d71767bcd1c1d9394962cd1f

.fillna() will be replaced with .ffill() and .bfill()

  • [x] addressed via 89da7259

Setting an item of incompatible dtype is deprecated

Details
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[<NA> 'VI' 'III6' <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I'
 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I'
 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I'
 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I'
 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I'
 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'iii' 'iii' 'iii'
 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii'
 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii'
 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii'
 'iii']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['i' 'iv6' 'V' 'V64(#6b5)/V' 'V43(b5)/V' 'V7(#4)' 'V7' 'V64' 'V6' 'v6'
 'V64(6b5)/VII' 'V43(b5)/VII' 'V7(#4)/III' 'V7/III' 'VII64' 'VII6' 'vii6'
 'i' '#viio65(4)' 'V64(6)' 'V7(#4)/V' 'V7/V' '#viio65(4)' 'V64(6)'
 'V7(#4)/V' 'V7/V' 'V7(#8)' 'V7(9)' 'v7' 'V7' 'VI(11)' 'VI' 'V65/VII'
 'V(64)/III' 'vii%65/VII' 'V43/VII' 'V/III' 'V2/III' 'III6' 'VI6/iv'
 '#viio7/iv' 'iv(4)' 'iv' 'bII6/iv' 'bIIM65/iv' 'iio6/iv' 'V(4)/iv' 'V/iv'
 'V7/iv' '#viio7(#4)/ii' 'V6(#6)/ii' 'V65(b5)/ii' 'V(4)/V' 'V/V'
 'vii%43/V' '#iii64' 'V7' 'I(74#2)' 'I' 'vii%43/V' 'viio43/V' 'V6(#11)'
 'V6' '#iii7' 'V7(4)/ii' 'V/ii' 'V7(#13)/V' 'V7/V' 'viio2/V' 'viio7/V'
 'viio2(4)/V' 'viio2/V' 'V6/iv' 'V43/iv' 'iv6(#7#4)' 'iv6(#7)' 'iv6'
 'viio6/V' 'V64/V' 'ii%7/V' 'III64' '#viio7(4)' '#viio7' 'vii%65/VII'
 'V43/VII' 'V43(b5)/VII' 'V7/III' 'v6' 'viio64/III' 'V65/VI' 'iv64/iv'
 '#viio7/iv' 'V6/iv' '#viio7/iv' 'iv(4)' 'iv' 'viio6(b3)/III'
 'V43(b5)/III' 'vii%65(b3)/III' 'V7(#4)/VI' 'V7/VI' 'viio6(b3)/III'
 'V43(b5)/III' 'vii%65(b3)/III' 'V7(#4)/VI' 'V7/VI' '#viio6(b3)/iv'
 'V43(b5)/iv' '#viio65(b3)/iv' 'V7(#4)/VII' 'V7/VII' '#viio6(b3)/iv'
 'V43(b5)/iv' '#viio65(b3)/iv' 'V7(#4)/VII' 'V7/VII' 'viio6(b3)/V'
 'V43(b5)/V' 'viio65(b3)/V' 'V7(b9)/V' 'V7/V' 'viio6(b3)/V' 'V43(b5)/V'
 'viio65(b3)/V' 'V7(b9)/V' 'V7/V' 'viio65/V' 'V64(b9)/V' '#viio65/iii'
 'vii%7/V' 'V65/iii' 'V7/iii' 'I(#4)' 'I' 'vii%43/V' 'viio43/V' 'V6(#4)'
 'V6' 'iii7' 'V7(4)/ii' 'V/ii' 'V7(13)/V' 'V7/V' 'viio2/V' 'viio7/V'
 'V6(b9)/V' 'viio2(4)/V' 'viio2/V' 'I6' 'V43/IV' 'viio6/IV' 'V6(6)/vi'
 'vi' 'IV6' 'vii%65/V' 'v6(#6#4)' 'v6' 'V6' '#viio65/vi' 'iv6(6#4)' 'iv6'
 'V65/ii' 'V64' '#viio7(4)/iii' '#viio7/iii' 'V64(2)/ii' 'V64/ii' 'V43/ii'
 'V7/V' 'vii%43/V' 'V65' 'ii43' '#viio7/vi' 'V65/vi' '#viio7/vi' 'IV6'
 'ii64' 'V43/V' 'viio65/V' 'bIII64(13)' 'bIII64' 'bIII64(b6)'
 'V43(42)/bVII' 'V43(4)/bVII' 'V43/bVII' 'vii%7/bIII' 'viio7/bIII'
 'viio64/bVI' 'V2/bVI' 'bII6/IV' 'ii%7/IV' 'V64(4)/IV' 'viio7/IV' 'IV(4)'
 'V7/bVII' 'V6(b6b2)/V' 'V6/V' 'viio(b3)/V' 'V(4)' 'V' 'IV' 'ii6'
 'V7(#4#2)' 'V7' 'V7(9)' 'V' 'iii6' 'V+' 'I64' 'V' 'vi' 'IV64' 'V(6)' 'V7'
 'viio2' 'ii43' 'V7(#4)' 'V7' 'V' 'IV6' 'V(6)' 'V7' 'viio2' 'ii43'
 'V7(#4)' 'V7' 'V7(9)' 'V7' 'V7(b94)' 'V' 'V64(6b5)/VII' 'V43(b5)/VII'
 'V7(#11)/III' 'V7/III' 'V7(9)/III' 'V7/III' 'V7(9)/III' 'V7(b94)/III'
 'V/III' 'III(964)' 'III(4#2)' 'III' 'V7(#11)/V' 'V7/V' 'V7(#9)' 'V7' 'VI'
 'VI(4)' 'VI' 'viio65/V' 'III64' 'V43(42)/VII' 'V43(4)/VII' 'V43/VII'
 'V7(9)/III' 'iio6/III' '#viio65/iv' 'iv64/iv' 'iii7' 'iii2' 'viio7/bII'
 'ii%7/bII' 'iio64/bII' 'V7/bII' 'V7(b5)/bII' 'viio6(2)/bII'
 'V43(#7b52)/bII' 'V43(b5)/bII' 'V7/bV' 'ii%7/bV' 'iio6(#7)/bV' 'iio6/bV'
 'viio/bV' 'V64(#9)' 'V64' 'ii%7/bV' 'iio6/bV' 'V6' 'ii%7/bV' 'iio6/bV'
 'V7(b9)/bV' 'V6' 'ii%7/bV' 'V64(#6b5)/V' 'V43(b5)/V' 'V7(#4)' 'V7' 'V'
 'V(b9)' 'V6' 'v6' 'V64(6b5)/VII' 'V43(b5)/VII' 'V7(#4)/III' 'V7/III'
 'VII' 'VII(b2)' 'VII6' 'vii6' 'ii%7' 'V43(b5)' 'V7(#4)/iv' 'V7/iv'
 'viio6(b3)/III' 'V43(b5)/III' 'vii%65(b3)/III' 'V7(#4)/VI' 'V7/VI'
 '#viio6(b3)/iv' 'V43(b5)/iv' '#viio65(b3)/iv' 'V7(#4)/VII' 'V7/VII' 'iv6'
 'ii%43' 'iv65' 'V7(9)/V' 'V7' 'VI(11)' 'VI' 'iv' 'iio6' 'ii%65' 'iio6'
 '#viio43(#4)' '#viio43' 'v%43' 'vii6' 'v%43' '#vii%65' 'V43' 'V43(b5)'
 '#vii%65(b3)' '#viio2/iv' '#vi%7' '#vio' 'viio65(b3)/V' 'V7(94)' 'V7(9)'
 'V' 'V(9)' 'V7' '#viio43(4)' '#vii%43(4)' '#viio43(#7)' '#viio43' 'V'
 'V(9)' 'V' 'V64(6b5)/V' 'V43(b5)/V' 'V7(#4)' 'V7' 'iv6' 'V' 'i6' '#viio'
 'iv' 'iv6' 'V']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['i' 'iv' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'v' 'V' 'V' 'V' 'V' 'VII' 'VII'
 'vii' 'i' '#vii' 'V' 'V' 'V' '#vii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'v' 'V' 'VI' 'VI'
 'V' 'V' 'vii' 'V' 'V' 'V' 'III' 'VI' '#vii' 'iv' 'iv' 'bII' 'bII' 'ii'
 'V' 'V' 'V' '#vii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'vii' '#iii' 'V' 'I' 'I' 'vii' 'vii'
 'V' 'V' '#iii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'vii' 'vii' 'vii' 'vii' 'V' 'V' 'iv' 'iv'
 'iv' 'vii' 'V' 'ii' 'III' '#vii' '#vii' 'vii' 'V' 'V' 'V' 'v' 'vii' 'V'
 'iv' '#vii' 'V' '#vii' 'iv' 'iv' 'vii' 'V' 'vii' 'V' 'V' 'vii' 'V' 'vii'
 'V' 'V' '#vii' 'V' '#vii' 'V' 'V' '#vii' 'V' '#vii' 'V' 'V' 'vii' 'V'
 'vii' 'V' 'V' 'vii' 'V' 'vii' 'V' 'V' 'vii' 'V' '#vii' 'vii' 'V' 'V' 'I'
 'I' 'vii' 'vii' 'V' 'V' 'iii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'vii' 'vii' 'V' 'vii' 'vii'
 'I' 'V' 'vii' 'V' 'vi' 'IV' 'vii' 'v' 'v' 'V' '#vii' 'iv' 'iv' 'V' 'V'
 '#vii' '#vii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'vii' 'V' 'ii' '#vii' 'V' '#vii' 'IV' 'ii'
 'V' 'vii' 'bIII' 'bIII' 'bIII' 'V' 'V' 'V' 'vii' 'vii' 'vii' 'V' 'bII'
 'ii' 'V' 'vii' 'IV' 'V' 'V' 'V' 'vii' 'V' 'V' 'IV' 'ii' 'V' 'V' 'V' 'V'
 'iii' 'V' 'I' 'V' 'vi' 'IV' 'V' 'V' 'vii' 'ii' 'V' 'V' 'V' 'IV' 'V' 'V'
 'vii' 'ii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V'
 'III' 'III' 'III' 'V' 'V' 'V' 'V' 'VI' 'VI' 'VI' 'vii' 'III' 'V' 'V' 'V'
 'V' 'ii' '#vii' 'iv' 'iii' 'iii' 'vii' 'ii' 'ii' 'V' 'V' 'vii' 'V' 'V'
 'V' 'ii' 'ii' 'ii' 'vii' 'V' 'V' 'ii' 'ii' 'V' 'ii' 'ii' 'V' 'V' 'ii' 'V'
 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'v' 'V' 'V' 'V' 'V' 'VII' 'VII' 'VII' 'vii' 'ii'
 'V' 'V' 'V' 'vii' 'V' 'vii' 'V' 'V' '#vii' 'V' '#vii' 'V' 'V' 'iv' 'ii'
 'iv' 'V' 'V' 'VI' 'VI' 'iv' 'ii' 'ii' 'ii' '#vii' '#vii' 'v' 'vii' 'v'
 '#vii' 'V' 'V' '#vii' '#vii' '#vi' '#vi' 'vii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' '#vii'
 '#vii' '#vii' '#vii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'iv' 'V' 'i' '#vii' 'iv'
 'iv' 'V']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 'o' nan nan nan 'o' nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan '%' nan
 nan nan nan nan 'o' nan nan nan 'M' 'o' nan nan nan 'o' nan nan nan nan
 '%' nan nan nan nan '%' 'o' nan nan nan nan nan nan nan 'o' 'o' 'o' 'o'
 nan nan nan nan nan 'o' nan '%' nan 'o' 'o' '%' nan nan nan nan 'o' nan
 nan 'o' nan 'o' nan nan 'o' nan '%' nan nan 'o' nan '%' nan nan 'o' nan
 'o' nan nan 'o' nan 'o' nan nan 'o' nan 'o' nan nan 'o' nan 'o' nan nan
 'o' nan 'o' '%' nan nan nan nan '%' 'o' nan nan nan nan nan nan nan 'o'
 'o' nan 'o' 'o' nan nan 'o' nan nan nan '%' nan nan nan 'o' nan nan nan
 nan 'o' 'o' nan nan nan nan '%' nan nan 'o' nan 'o' nan nan nan 'o' nan
 nan nan nan nan nan '%' 'o' 'o' nan nan '%' nan 'o' nan nan nan nan 'o'
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan '+' nan nan nan nan nan nan 'o' nan
 nan nan nan nan nan nan 'o' nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan 'o' nan nan
 nan nan nan 'o' 'o' nan nan nan 'o' '%' 'o' nan nan 'o' nan nan nan '%'
 'o' 'o' 'o' nan nan '%' 'o' nan '%' 'o' nan nan '%' nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan '%' nan nan nan 'o' nan '%'
 nan nan 'o' nan 'o' nan nan nan '%' nan nan nan nan nan nan 'o' '%' 'o'
 'o' 'o' '%' nan '%' '%' nan nan '%' 'o' '%' 'o' 'o' nan nan nan nan nan
 'o' '%' 'o' 'o' nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan 'o' nan nan nan]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan '6' nan '64' '43' '7' '7' '64' '6' '6' '64' '43' '7' '7' '64' '6' '6'
 nan '65' '64' '7' '7' '65' '64' '7' '7' '7' '7' '7' '7' nan nan '65' nan
 '65' '43' nan '2' '6' '6' '7' nan nan '6' '65' '6' nan nan '7' '7' '6'
 '65' nan nan '43' '64' '7' nan nan '43' '43' '6' '6' '7' '7' nan '7' '7'
 '2' '7' '2' '2' '6' '43' '6' '6' '6' '6' '64' '7' '64' '7' '7' '65' '43'
 '43' '7' '6' '64' '65' '64' '7' '6' '7' nan nan '6' '43' '65' '7' '7' '6'
 '43' '65' '7' '7' '6' '43' '65' '7' '7' '6' '43' '65' '7' '7' '6' '43'
 '65' '7' '7' '6' '43' '65' '7' '7' '65' '64' '65' '7' '65' '7' nan nan
 '43' '43' '6' '6' '7' '7' nan '7' '7' '2' '7' '6' '2' '2' '6' '43' '6'
 '6' nan '6' '65' '6' '6' '6' '65' '6' '6' '65' '64' '7' '7' '64' '64'
 '43' '7' '43' '65' '43' '7' '65' '7' '6' '64' '43' '65' '64' '64' '64'
 '43' '43' '43' '7' '7' '64' '2' '6' '7' '64' '7' nan '7' '6' '6' nan nan
 nan nan '6' '7' '7' '7' nan '6' nan '64' nan nan '64' nan '7' '2' '43'
 '7' '7' nan '6' nan '7' '2' '43' '7' '7' '7' '7' '7' nan '64' '43' '7'
 '7' '7' '7' '7' '7' nan nan nan nan '7' '7' '7' '7' nan nan nan '65' '64'
 '43' '43' '43' '7' '6' '65' '64' '7' '2' '7' '7' '64' '7' '7' '6' '43'
 '43' '7' '7' '6' '6' nan '64' '64' '7' '6' '6' '7' '6' '7' '6' '7' '64'
 '43' '7' '7' nan nan '6' '6' '64' '43' '7' '7' nan nan '6' '6' '7' '43'
 '7' '7' '6' '43' '65' '7' '7' '6' '43' '65' '7' '7' '6' '43' '65' '7' '7'
 nan nan nan '6' '65' '6' '43' '43' '43' '6' '43' '65' '43' '43' '65' '2'
 '7' nan '65' '7' '7' nan nan '7' '43' '43' '43' '43' nan nan nan '64'
 '43' '7' '7' '6' nan '6' nan nan '6' nan]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan nan nan '#6b5' 'b5' '#4' nan nan nan nan '6b5' 'b5' '#4' nan nan nan
 nan nan '4' '6' '#4' nan '4' '6' '#4' nan '#8' '9' nan nan '11' nan nan
 '64' nan nan nan nan nan nan nan '4' nan nan nan nan '4' nan nan '#4'
 '#6' 'b5' '4' nan nan nan nan '74#2' nan nan nan '#11' nan nan '4' nan
 '#13' nan nan nan '4' nan nan nan '#7#4' '#7' nan nan nan nan nan '4' nan
 nan nan 'b5' nan nan nan nan nan nan nan nan '4' nan 'b3' 'b5' 'b3' '#4'
 nan 'b3' 'b5' 'b3' '#4' nan 'b3' 'b5' 'b3' '#4' nan 'b3' 'b5' 'b3' '#4'
 nan 'b3' 'b5' 'b3' 'b9' nan 'b3' 'b5' 'b3' 'b9' nan nan 'b9' nan nan nan
 nan '#4' nan nan nan '#4' nan nan '4' nan '13' nan nan nan 'b9' '4' nan
 nan nan nan '6' nan nan nan '#6#4' nan nan nan '6#4' nan nan nan '4' nan
 '2' nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan '13' nan 'b6'
 '42' '4' nan nan nan nan nan nan nan '4' nan '4' nan 'b6b2' nan 'b3' '4'
 nan nan nan '#4#2' nan '9' nan nan nan nan nan nan nan '6' nan nan nan
 '#4' nan nan nan '6' nan nan nan '#4' nan '9' nan 'b94' nan '6b5' 'b5'
 '#11' nan '9' nan '9' 'b94' nan '964' '4#2' nan '#11' nan '#9' nan nan
 '4' nan nan nan '42' '4' nan '9' nan nan nan nan nan nan nan nan nan 'b5'
 '2' '#7b52' 'b5' nan nan '#7' nan nan '#9' nan nan nan nan nan nan 'b9'
 nan nan '#6b5' 'b5' '#4' nan nan 'b9' nan nan '6b5' 'b5' '#4' nan nan
 'b2' nan nan nan 'b5' '#4' nan 'b3' 'b5' 'b3' '#4' nan 'b3' 'b5' 'b3'
 '#4' nan nan nan nan '9' nan '11' nan nan nan nan nan '#4' nan nan nan
 nan nan nan 'b5' 'b3' nan nan nan 'b3' '94' '9' nan '9' nan '4' '4' '#7'
 nan nan '9' nan '6b5' 'b5' '#4' nan nan nan nan nan nan nan nan]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan nan nan 'V' 'V' nan nan nan nan nan 'VII' 'VII' 'III' 'III' nan nan
 nan nan nan nan 'V' 'V' nan nan 'V' 'V' nan nan nan nan nan nan 'VII'
 'III' 'VII' 'VII' 'III' 'III' nan 'iv' 'iv' nan nan 'iv' 'iv' 'iv' 'iv'
 'iv' 'iv' 'ii' 'ii' 'ii' 'V' 'V' 'V' nan nan nan nan 'V' 'V' nan nan nan
 'ii' 'ii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'iv' 'iv' nan nan nan 'V' 'V' 'V' nan
 nan nan 'VII' 'VII' 'VII' 'III' nan 'III' 'VI' 'iv' 'iv' 'iv' 'iv' nan
 nan 'III' 'III' 'III' 'VI' 'VI' 'III' 'III' 'III' 'VI' 'VI' 'iv' 'iv'
 'iv' 'VII' 'VII' 'iv' 'iv' 'iv' 'VII' 'VII' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V'
 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'iii' 'V' 'iii' 'iii' nan nan 'V' 'V' nan nan nan
 'ii' 'ii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' nan 'IV' 'IV' 'vi' nan nan 'V' nan
 nan nan 'vi' nan nan 'ii' nan 'iii' 'iii' 'ii' 'ii' 'ii' 'V' 'V' nan nan
 'vi' 'vi' 'vi' nan nan 'V' 'V' nan nan nan 'bVII' 'bVII' 'bVII' 'bIII'
 'bIII' 'bVI' 'bVI' 'IV' 'IV' 'IV' 'IV' nan 'bVII' 'V' 'V' 'V' nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan 'VII' 'VII' 'III' 'III' 'III'
 'III' 'III' 'III' 'III' nan nan nan 'V' 'V' nan nan nan nan nan 'V' nan
 'VII' 'VII' 'VII' 'III' 'III' 'iv' 'iv' nan nan 'bII' 'bII' 'bII' 'bII'
 'bII' 'bII' 'bII' 'bII' 'bV' 'bV' 'bV' 'bV' 'bV' nan nan 'bV' 'bV' nan
 'bV' 'bV' 'bV' nan 'bV' 'V' 'V' nan nan nan nan nan nan 'VII' 'VII' 'III'
 'III' nan nan nan nan nan nan 'iv' 'iv' 'III' 'III' 'III' 'VI' 'VI' 'iv'
 'iv' 'iv' 'VII' 'VII' nan nan nan 'V' nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan 'iv' nan nan 'V' nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan 'V' 'V' nan nan nan nan nan nan nan nan nan]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan nan nan nan nan nan '\\\\' nan nan nan nan nan nan '\\\\' nan nan nan
 nan nan nan nan '\\\\' nan nan nan '\\\\' nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan '\\\\']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['m' 'm' 'M' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M' 'm' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'M'
 'M' 'm' 'm' 'o7' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'o7' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'mm7'
 'Mm7' 'M' 'M' 'Mm7' 'M' '%7' 'Mm7' 'M' 'Mm7' 'M' 'M' 'o7' 'm' 'm' 'M'
 'MM7' 'o' 'M' 'M' 'Mm7' 'o7' 'M' 'Mm7' 'M' 'M' '%7' 'm' 'Mm7' 'M' 'M'
 '%7' 'o7' 'M' 'M' 'mm7' 'Mm7' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'o7' 'o7' 'o7' 'o7' 'M'
 'Mm7' 'm' 'm' 'm' 'o' 'M' '%7' 'M' 'o7' 'o7' '%7' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'm'
 'o' 'Mm7' 'm' 'o7' 'M' 'o7' 'm' 'm' 'o' 'Mm7' '%7' 'Mm7' 'Mm7' 'o' 'Mm7'
 '%7' 'Mm7' 'Mm7' 'o' 'Mm7' 'o7' 'Mm7' 'Mm7' 'o' 'Mm7' 'o7' 'Mm7' 'Mm7'
 'o' 'Mm7' 'o7' 'Mm7' 'Mm7' 'o' 'Mm7' 'o7' 'Mm7' 'Mm7' 'o7' 'M' 'o7' '%7'
 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M' '%7' 'o7' 'M' 'M' 'mm7' 'Mm7' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'o7'
 'o7' 'M' 'o7' 'o7' 'M' 'Mm7' 'o' 'M' 'm' 'M' '%7' 'm' 'm' 'M' 'o7' 'm'
 'm' 'Mm7' 'M' 'o7' 'o7' 'M' 'M' 'Mm7' 'Mm7' '%7' 'Mm7' 'mm7' 'o7' 'Mm7'
 'o7' 'M' 'm' 'Mm7' 'o7' 'M' 'M' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' '%7' 'o7' 'o' 'Mm7'
 'M' '%7' 'M' 'o7' 'M' 'Mm7' 'M' 'M' 'o' 'M' 'M' 'M' 'm' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7'
 'M' 'm' '+' 'M' 'M' 'm' 'M' 'M' 'Mm7' 'o7' 'mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M' 'M'
 'Mm7' 'o7' 'mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7'
 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M' 'M' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M'
 'M' 'o7' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'o' 'o7' 'm' 'mm7' 'mm7' 'o7' '%7'
 'o' 'Mm7' 'Mm7' 'o' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' '%7' 'o' 'o' 'o' 'M' 'M' '%7' 'o'
 'M' '%7' 'o' 'Mm7' 'M' '%7' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M' 'M' 'm' 'M'
 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M' 'M' 'm' '%7' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'o' 'Mm7' '%7'
 'Mm7' 'Mm7' 'o' 'Mm7' 'o7' 'Mm7' 'Mm7' 'm' '%7' 'mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M'
 'm' 'o' '%7' 'o' 'o7' 'o7' '%7' 'm' '%7' '%7' 'Mm7' 'Mm7' '%7' 'o7' '%7'
 'o' 'o7' 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M' 'Mm7' 'o7' '%7' 'o7' 'o7' 'M' 'M' 'M' 'M'
 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'm' 'M' 'm' 'o' 'm' 'm' 'M']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[ True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[ True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True False False False False
 False False False False False False False False False False False False
 False False False False False False False False False False False False
 False False False False False False False False False False False False
 False False False False False False False False False False False False
 False False False False False False False False False False False False
 False False False False False False False False False False False False
 False False False False False False False False False False False False
 False False False False False False False False False False False False
 False False  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[(3, 0, 4) (-1, 3, 2) (4, 8, 5) (-1, 5, 9) (-1, 3, 5, 9) (4, 8, 10, 2)
 (4, 8, 5, 2) (5, 4, 8) (8, 5, 4) (1, 5, 4) (-4, 5, 2, 6) (-4, 0, 2, 6)
 (1, 5, 7, -1) (1, 5, 2, -1) (2, 1, 5) (5, 2, 1) (-2, 2, 1) (3, 0, 4)
 (0, 2, -1, 8) (0, 4, 8) (5, 9, 11, 3) (5, 9, 6, 3) (0, 2, -1, 8)
 (0, 4, 8) (5, 9, 11, 3) (5, 9, 6, 3) (4, 8, 5, 2) (4, 8, 5, 2)
 (4, 1, 5, 2) (4, 8, 5, 2) (-1, 3, 0) (-1, 3, 0) (6, 3, 0, 2) (1, 0, 4)
 (3, 0, 4, 6) (3, 0, 2, 6) (1, 5, 2) (-1, 1, 5, 2) (4, 1, 0) (2, -1, -2)
 (7, 4, 1, -2) (2, 1, 3) (2, -1, 3) (1, -2, -3) (1, -2, 2, -3) (1, -2, 4)
 (3, 2, 4) (3, 7, 4) (3, 7, 4, 1) (10, 7, 9, 1) (10, 7, 6) (10, 0, 4, 6)
 (5, 4, 6) (5, 9, 6) (3, 7, 9, 6) (8, 7, 4) (4, 8, 5, 2) (3, 12, 2, 4)
 (3, 7, 4) (3, 7, 9, 6) (3, 0, 9, 6) (8, 5, 4) (8, 5, 4) (7, 4, 8, 5)
 (6, 5, 7, 4) (6, 10, 7) (5, 9, 6, 3) (5, 9, 6, 3) (0, 9, 6, 3)
 (9, 6, 3, 0) (0, 9, 8, 3) (0, 9, 6, 3) (7, 4, 3) (4, 1, 3, 7) (-1, 8, 7)
 (-1, 3, 7) (-1, 3, 2) (6, 3, 9) (6, 5, 9) (6, 3, 0, 4) (1, 0, 4)
 (8, 0, 2, -1) (8, 5, 2, -1) (3, 0, 4, 6) (3, 0, 2, 6) (-4, 0, 2, 6)
 (1, 5, 2, -1) (1, 5, 4) (-1, 5, 2) (4, 1, -2, 0) (2, 1, -2) (7, 4, 1, -2)
 (7, 4, 3) (7, 4, 1, -2) (2, 1, 3) (2, -1, 3) (-5, -1, 5) (-5, -1, 1, 5)
 (-5, -1, 3, 5) (0, 4, 6, -2) (0, 4, 1, -2) (-5, -1, 5) (-5, -1, 1, 5)
 (-5, -1, 3, 5) (0, 4, 6, -2) (0, 4, 1, -2) (-3, 1, 7) (-3, 1, 3, 7)
 (-3, 1, -2, 7) (2, 6, 8, 0) (2, 6, 3, 0) (-3, 1, 7) (-3, 1, 3, 7)
 (-3, 1, -2, 7) (2, 6, 8, 0) (2, 6, 3, 0) (-1, 3, 9) (-1, 3, 5, 9)
 (-1, 3, 0, 9) (5, 9, 6, 3) (5, 9, 6, 3) (-1, 3, 9) (-1, 3, 5, 9)
 (-1, 3, 0, 9) (5, 9, 6, 3) (5, 9, 6, 3) (6, 3, 0, 9) (6, 5, 9)
 (9, 6, 3, 12) (9, 6, 3, 7) (12, 9, 6, 8) (8, 12, 9, 6) (3, 7, 9)
 (3, 7, 4) (3, 7, 9, 6) (3, 0, 9, 6) (8, 10, 4) (8, 5, 4) (7, 4, 8, 5)
 (6, 5, 7, 4) (6, 10, 7) (5, 9, 6, 3) (5, 9, 6, 3) (0, 9, 6, 3)
 (9, 6, 3, 0) (9, 6, 5) (0, 9, 8, 3) (0, 9, 6, 3) (7, 4, 3) (4, 1, 3, 7)
 (4, 1, 7) (11, 3, 7) (6, 3, 7) (6, 3, 2) (6, 3, 7, 9) (1, 10, 4)
 (1, 5, 4) (8, 5, 4) (8, 5, 2, 11) (-1, 15, 5, 2) (-1, 3, 2) (10, 7, 4, 6)
 (5, 4, 8) (12, 4, 6, 3) (12, 9, 6, 3) (7, 1, 10) (7, 6, 10) (7, 4, 6, 10)
 (5, 9, 6, 3) (3, 7, 9, 6) (8, 5, 2, 4) (6, 3, 5, 2) (11, 8, 5, 2)
 (11, 8, 5, 7) (11, 8, 5, 2) (6, 3, 2) (6, 5, 2) (6, 3, 5, 9) (6, 3, 0, 9)
 (1, 0, 4) (1, 0, 4) (-4, 0, 4) (3, 0, 4, 1) (3, 0, 2, 1) (3, 0, 2, 6)
 (5, 2, -1, 3) (5, 2, -1, -4) (-2, 4, 1) (-2, 0, 4, 1) (1, -2, -3)
 (4, 1, -2, 2) (4, 3, 2) (7, 4, 1, -2) (2, 8, 3) (2, 6, 3, 0) (9, 1, 0)
 (9, 6, 5) (9, -1, 3) (4, 3, 5) (4, 8, 5) (2, 6, 3) (2, 6, 5)
 (4, 13, 10, 2) (4, 8, 5, 2) (4, 8, 5, 2) (4, 8, 5) (4, 8, 7) (4, 8, 12)
 (4, 3, 7) (4, 8, 5) (6, 3, 7) (3, 2, 6) (4, 8, 7) (4, 8, 5, 2)
 (-1, 8, 5, 2) (6, 3, 5, 2) (4, 8, 10, 2) (4, 8, 5, 2) (4, 8, 5) (6, 3, 2)
 (4, 8, 7) (4, 8, 5, 2) (-1, 8, 5, 2) (6, 3, 5, 2) (4, 8, 10, 2)
 (4, 8, 5, 2) (4, 8, 5, 2) (4, 8, 5, 2) (4, 3, 5, 2) (4, 8, 5)
 (-4, 5, 2, 6) (-4, 0, 2, 6) (1, 5, 2, -1) (1, 5, 2, -1) (1, 5, 2, -1)
 (1, 5, 2, -1) (1, 5, 2, -1) (1, 0, 2, -1) (1, 5, 2) (0, -1, 3)
 (0, 9, -1, 1) (0, 4, 1) (5, 9, 6, 3) (5, 9, 6, 3) (4, 8, 5, 2)
 (4, 8, 5, 2) (-1, 3, 0) (-1, 5, 0) (-1, 3, 0) (6, 3, 0, 9) (1, 0, 4)
 (3, 0, 4, 1) (3, 0, 2, 1) (3, 0, 2, 6) (1, 5, 2, -1) (-1, -4, 2)
 (4, 1, -2, 7) (2, 1, -2) (0, -3, 1, -2) (-2, 0, -3, 1) (3, 0, -3, -6)
 (0, -3, -6, -2) (-6, 0, -3) (-1, 3, 0, -3) (-1, 3, -7, -3) (0, -3, -2)
 (-7, -3, 1, 4, 3) (-7, -3, -1, 3) (-2, 2, -1, -4) (-1, -4, -7, -3)
 (-4, -7, 4) (-4, -7, -1) (2, -1, -4) (5, 4, 8) (5, 4, 8) (-1, -4, -7, -3)
 (-4, -7, -1) (8, 5, 4) (-1, -4, -7, -3) (-4, -7, -1) (-2, 2, -1, -4)
 (8, 5, 4) (-1, -4, -7, -3) (-1, 5, 9) (-1, 3, 5, 9) (4, 8, 10, 2)
 (4, 8, 5, 2) (4, 8, 5) (4, 8, 5) (8, 5, 4) (1, 5, 4) (-4, 5, 2, 6)
 (-4, 0, 2, 6) (1, 5, 7, -1) (1, 5, 2, -1) (1, 5, 2) (-4, 5, 2) (5, 2, 1)
 (-2, 2, 1) (5, 2, -1, 3) (-2, 2, 4, 8) (3, 7, 9, 1) (3, 7, 4, 1)
 (-5, -1, 5) (-5, -1, 1, 5) (-5, -1, 3, 5) (0, 4, 6, -2) (0, 4, 1, -2)
 (-3, 1, 7) (-3, 1, 3, 7) (-3, 1, -2, 7) (2, 6, 8, 0) (2, 6, 3, 0)
 (-1, 3, 2) (-1, 3, 5, 2) (-1, 3, 0, 2) (5, 9, 6, 3) (4, 8, 5, 2)
 (-1, 3, 0) (-1, 3, 0) (-1, -4, 0) (-1, -4, 2) (-1, -4, 0, 2) (-1, -4, 2)
 (4, -4, 5, 2) (-1, -4, 5, 2) (-5, -1, 1, -2) (-5, -1, -2) (-5, -1, 1, -2)
 (2, -1, 3, 5) (2, -1, 1, 5) (-5, -1, 1, 5) (-5, -1, 3, 5) (-5, 4, 1, -2)
 (3, 0, -3, 1) (3, 0, -3) (-4, 0, -3, 6) (1, 0, 2, -1) (1, 5, 2, -1)
 (1, 5, 2) (1, 5, 2) (1, 5, 2, -1) (-1, -4, 5, -3) (-1, 3, 5, -3)
 (-1, -4, 3, 2) (-1, -4, 5, 2) (1, 5, 2) (1, 5, 2) (1, 5, 2) (-4, 5, 2, 6)
 (-4, 0, 2, 6) (1, 5, 7, -1) (1, 5, 2, -1) (-4, 0, -1) (1, 5, 2)
 (-3, 1, 0) (5, 2, -1) (-1, -4, 0) (-4, 0, -1) (1, 5, 2)]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[() () () (15,) () () () () () () () () () () () () () () () () () () ()
 () () () () (-1,) () () (5,) () () () () () () () () () () () () () () ()
 () () () () (9,) () () () () () () (1,) () () () (10,) () () () () (15,)
 () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () ()
 () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () ()
 () () () () (0,) () () () () (0,) () () (0,) () () () () () () () () ()
 () () () () (8,) () () () (0,) () () () () () () () () () (14,) () () ()
 () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () (3,) () () ()
 () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () (6,) () ()
 () () () () () () () () () () () () () () () () () () () (6,) () (-1,) ()
 () () (7,) () (3,) () (3,) (-4,) () (2,) () () (11,) () (6,) () () () ()
 () () () () () (3,) () () () () () () () () () () () () () () () () () ()
 (6,) () () () () () () (-7,) () () (15,) () () () () (-8,) () () () () ()
 () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () (7,) ()
 (5,) () () () () () () () () () () () () () () () () () () (-4,) (-4,) ()
 (-4,) () () () () () () (-4,) () () () () () () () () () () () ()]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:406: FutureWarning: DataFrame.fillna with 'method' is deprecated and will raise in a future version. Use obj.ffill() or obj.bfill() instead.
  df.loc[:, key_cols] = df[key_cols].fillna(method='ffill')
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/expand_dcml.py:631: FutureWarning: Series.fillna with 'method' is deprecated and will raise in a future version. Use obj.ffill() or obj.bfill() instead.
  df[localkey].fillna(method="ffill", inplace=True)
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[<NA> <NA> <NA> ... <NA> <NA> <NA>]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['C' 'C' 'C' ... 'C' 'C' 'C']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['I' 'I' 'I' ... 'I' 'I' 'I']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan nan nan ... nan nan nan]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['I' 'IM2' 'vi7' ... 'I6' 'I64' 'I']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['I' 'I' 'vi' ... 'I' 'I' 'I']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan 'M' nan ... nan nan nan]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan '2' '7' ... '6' '64' nan]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan nan nan ... nan nan '\\\\']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['M' 'MM7' 'mm7' ... 'M' 'M' 'M']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[False False False ... False False False]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[(0, 4, 1) (5, 0, 4, 1) (3, 0, 4, 1) ... (4, 1, 0) (1, 0, 4) (0, 4, 1)]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[() () () ... () () ()]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:406: FutureWarning: DataFrame.fillna with 'method' is deprecated and will raise in a future version. Use obj.ffill() or obj.bfill() instead.
  df.loc[:, key_cols] = df[key_cols].fillna(method='ffill')

ms3 version

  • ms3 v2.2.1
  • pandas 2.1.0

johentsch avatar Sep 05 '23 13:09 johentsch