PHYSBO

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How to adjust the parameters of the optimization process?

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Hi, thank you very much for your work, this library helped me a lot. I found that I am not getting the desired optimization result during the optimization process, I...

qup20

manual でのparameter selection

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現状、parameter searchの方法として、 - random_search https://github.com/issp-center-dev/PHYSBO/blob/master/physbo/search/discrete/policy.py#L137 - bayes_search https://github.com/issp-center-dev/PHYSBO/blob/master/physbo/search/discrete/policy.py#L205 の２通りが実装されているかと思います。 これらに加え、ユーザがmanualでactionを指定できる機能が実装されると有用に感じたのですがいかがでしょうか？ 今後実装の予定はございますでしょうか？ 実験からのinteractive実行でPHYSBOを活用させていただいているのですが、登録しそこねたり失敗した実験を再実験したい場合に、actionのmanual selection機能があると有用かと感じました。

yuki-asano

physbo.search.discrete_multi.policyのインタラクティブ実行時の挙動

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多目的最適化の計算をインタラクティブ実行すると、以下のような挙動になりました。 1. `physbo.search.utility.show_search_results_mo`の履歴に最初の一個目の結果が表示されない（表示数が2以上の場合） 1. `policy.get_post_fmean`実行時に`ValueError: shapes (100,10) and (9,) not aligned: 10 (dim 1) != 9 (dim 0)`のようなエラーが発生 なお、2.のエラーに関してはsimulatorクラスを定義して実行した場合には発生しませんでした。 設定の間違いや回避策などがあればご教示いただければ幸いです。 #### 実行環境 + Windows10 64bit + Python 3.10.7 + PHYSBO...

yamato-m-csc

Hi developers, I'm Hikaru Sawahata (PKSHA tech.) For teaching materials of the bayesian optimization, I'm developing a web application of PHYSBO with streamlit. [physbo-streamlit.herokuapp](https://physbo-streamlit.herokuapp.com/) If you don't mind, please try...

hikaruri

Can physbo handle sparse features?

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```python from scipy import sparse X = sparse.csr_matrix(...) ```

UnixJunkie

physbo.search.discrete.policy.bayes_searchのログ出力

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is_dispをFalseにしても下記のようにログが出力されます。 ログを出力しないようにしたいのですが、何が原因でしょうか？ [実行環境] windows10 64bit Python 3.7.4 anaconda version 1.7.2 physbo == 1.0.0 Jupyter Notebook ``` policy.bayes_search( training=None, max_num_probes=50, num_search_each_probe=1, predictor=None, is_disp=False, simulator=None, score='EI', interval=0, num_rand_basis=0 ) Start the hyper...

tkrhsn

For windows OS, the problem failure to import physbo using anaconda navigator has been reported. When you see the following error, please uninstall numpy and install numpy again (numpy>=1.20 works)....

k-yoshimi

The new class sfs is added in physbo.gp for satisfying the sciket-learn library. New function is created in sfs: 1. Fit 2. Predict 3. get_params The usage for sfs class...

HengyuLi-Ozaki-lab

ファイルからロードした後に新しい結果を書き込めない

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`history`クラスの内容を`save`メソッドでnpzファイルに保存しておいたものを`load`メソッドで読み込み、複数のアクションの結果を書き込もうとするとエラーになります。再現コードは以下のとおりです。 ``` from physbo.search.discrete import history his = history() his.write(t=[3.14], action=[0]) his.save("history.npz") his.load("history.npz") his.write(t=[2.18, 1.618], action=[1, 2]) # ValueError: could not broadcast input array from shape (2,) into shape (0,)...

k-kitai

MPI並列で実行する際に、save で保存した policy を load すると、以下のエラーが出ます。 > Traceback (most recent call last): > File "/home/user/work/physbo/work/tutorial3_mpi/run4b.py", line 41, in > policy.load(file_history='history.npz', file_training='training.npz', file_predictor='predictor.dump') > File "/home/user/.conda/envs/py39-physbo/lib/python3.9/site-packages/physbo/search/discrete/policy.py", line 697, in load >...

aoymt