zhang dong

仔细检查下你的序列里面是不是有i，以及看下你序列的名字里面是不是也有不被识别的字符。 Chenxiaona ***@***.***> 于2023年5月10日周三 17:07写道： > > 老师，您好。对序列进行比对时出现了以下问题，这里报错的意思时序列里面含有特殊字符吗？我检查了所有序列，里面没有特殊字符，对于这种情况，我应该如何解决这个问题？ > 还有，如果没有解决以下报错问题的话，我把这些序列在其他软件(geneious)进行比对后，再到phylosuite跑树的话还会报错吗？ > Gap Penalty = -1.53, +0.00, +0.00 > === Alphabet 'i' is unknown. > === Please check site 1 in...

. 是没有序列的意思，你检查一下比对成功没有。只要每一列的符号一样就会显示星号，对于你这种情况，星号没有什么意义。 CXna1108 ***@***.***> 于2023年5月6日周六 19:48写道： > 1.老师您好。想问一下，就是将比对好的序列在PhyloSuit > Viewer界面打开后，序列的某些部分是.......（点点点），这代表什么意思？是没有序列的意思吗？没有有序列的区域因该显示的是------这些符号吧？ > 2.还有没有序列的区域，在最上方的*****这些符号又是什么意思呢？ > > — > Reply to this email directly, view it on GitHub > , or unsubscribe >...

Please check your GenBank file carefully, better to make a standard GenBank file and try again.

1. 确认是不是用的最新版（1.2.3）的phylosuite 2. 如果是最新版，换一个内存更大的电脑续跑试试 Chenxiaona ***@***.***> 于2023年5月12日周五 20:06写道： > 老师，关于以下存储空间不足和字符报错一般怎么解决？ > Division 1 has 708 unique site patterns > Initializing conditional likelihoods > Using standard non-SSE likelihood calculator for division...

合并序列是什么意思？串联吗。还有，你是不是按教程来操作的，可以看下我们最新发表的protocol： https://mp.weixin.qq.com/s/my1tp_OY6iy2USPbqoJ3VQ Aria-47 ***@***.***> 于2024年7月24日周三 15:07写道： > 老师，想问一下合并序列import to bayes之后显示Traceback (most recent call last): > File "PhyloSuite/src/CustomWidget.py", line 702, in columnCount > IndexError: list index out of range是怎么回事啊 > >...