db-beep

预训练步骤

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作者您好，我在试图将SDCN框架运用到我自己的数据集上遇到一些问题，想向您请教。（无标签+非graph数据） 根据您之前说的将SDCN运用到其他数据集的三个步骤，第一步，创建自己数据集的KNN图，这一步我已经完成。第二步预训练步骤，我所输入的x的shape为[8500，20000]，然后根据代码，需要修改model=AE{}这一部分的代码，在CPU/GPU上训练都提示大小不匹配的问题，即使将预训练的网络修改成shape相同的，同样还是无法训练。

how to use n2d in other datasets？

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Hi，author， I want to apply my own data set to n2d.data.shape[90,20000],sample:90,feature:20000,what should I do？ thanks

don't run the codes

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Preprocess input files python -W ignore PreprocessingscGNN.py --datasetName GSE138852_counts.csv.gz --datasetDir GSE138852/ --LTMGDir GSE138852/ --filetype CSV --geneSelectnum 2000 --inferLTMGTag error information： R[write to console]: 在启动过程中 - R[write to console]: Warning messages:...

I tried to replace the experimental data with other data sets (not pictures), and I couldn't run the code.