PDF 编译错误

[qiushiyan]

我对 latex 排错能力有限，先把我碰到过的错误贴上来。

第一个错误是 bookdown.post.latex 里面的这一行

https://github.com/cosname/rmarkdown-guide/blob/e24c2dfa4ed24b32fa9acb619d9ca4dbe345bf37/index.Rmd#L55

报错信息是

 Error in seq.default(dots[[1L]][[5L]], dots[[2L]][[5L]]) : 
  'to' must be a finite number 
10.
stop("'to' must be a finite number") 
9.
seq.default(dots[[1L]][[5L]], dots[[2L]][[5L]]) 
8.
(function (...) 
UseMethod("seq"))(dots[[1L]][[5L]], dots[[2L]][[5L]]) 
7.
mapply(seq, i1, i2, SIMPLIFY = FALSE) at <text>#29
6.
unlist(mapply(seq, i1, i2, SIMPLIFY = FALSE)) at <text>#29
5.
post(x) 
4.
output_format$post_processor(front_matter, input, output_file, 
    clean, !quiet) 
3.
rmarkdown::render(main, output_format, ..., clean = clean, envir = envir) 
2.
render_cur_session(files, main, config, output_format, clean, 
    envir, ...) 
1.
bookdown::render_book("index.Rmd", "bookdown::pdf_book") 

估计这里是前面的 i1 和 i2 出现了 Inf，这一行注释掉后可以消除错误。

第二错误是两张图片

https://github.com/cosname/rmarkdown-guide/blob/master/01-intro.Rmd#L139-L143

https://github.com/cosname/rmarkdown-guide/blob/master/03-document.Rmd#L170-L174

这两个图的 fig.cap 都是用了 (ref:label) 语法，错误是一样的，例如第二个图生成的 tex 是

\begin{figure}

{\centering \includegraphics{examples/first-rmd-theme-darkly} 

}

\caption{应用 \href{https://bootswatch.com/3/darkly}{darkly} 主题后的文档样式}\label{fig:first-rmd-theme-darkly}
\end{figure}

报错 log 是

! Argument of \@tempf has an extra }.
<inserted text> 
                \par 

把它们都改成行内 fig.cap 可以解决这个问题

第三个错误我没有找到具体的报错位置，错误信息是

! Undefined control sequence.
<argument> @{} >{\raggedright \arraybackslash 
                                              }p{(\columnwidth - 2\tabcolsep...
l.967 ...width - 2\tabcolsep) * \real{0.7639}}@{}}

log 文件是

https://gist.github.com/qiushiyan/2956afa6c2cbd2892c955d962ccfbfe1

此外 #80 还会带来一个新错误

Error running filter /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.2-arm64/Resources/library/rmarkdown/rmarkdown/lua/latex-div.lua:
.../Resources/library/rmarkdown/rmarkdown/lua/latex-div.lua:52: attempt to index a nil value (field 'integer index')
stack traceback:
Error: pandoc document conversion failed with error 83

可能有关 https://community.rstudio.com/t/pandoc-document-conversion-failed-with-error-83/138962

[rucwyf]

我暂时修好了pdf这个问题，具体而言：

• 对于第一个错误，我先给注释掉了

• 对于第二个错误，我改了一下叙述方式

• 第三个错误我这里没有报错

• 关于 #80 带来的错误：第2章和第6章有一些下面这样的代码，删去即可解决这个错误，输出也没有变化（可以检查一下）。

::: {.col data-latex="{0.05\textwidth}"}

:::

• 我还发现没法编译第二章的![R logo](https://www.r-project.org/Rlogo.png)，我把它换成了

```{r echo = FALSE, fig.cap="Rlogo"}
knitr::include_graphics("images/Rlogo.png", dpi = NA)
```

• 对于pdf无法输出动图，我把第二章动画部分的代码改成了

```{r, animation.hook="gifski", echo = FALSE}
if (knitr::is_html_output()){
  for (i in 1:2) {
    pie(c(i %% 2, 6), col = c("red", "yellow"), labels = NA)
  }
}
```

• 另外，第二章表格部分的代码在pdf里会报错

| 元素   | Markdown        |
|--------|-----------------|
| 块引用 | `> some quotes` |
| 代码块 | `some code`     |

\toprule ->\noalign 
                    {\ifnum 0=`}\fi \@aboverulesep =\abovetopsep \global \@b...
l.1468 \toprule
               () 

好像 bookdown 输出pdf时只能用 knitr::kable() 来输出，我就调整了一下，顺便改了一些这里的例子，不然还要处理“```"会变成中文引号的问题。第三章也有两个地方有相应的问题，我都改了。

• Asymptote 部分的图像输出有问题，我看 R Markdown Cookbook 也有这个问题，我先把这部分删去了，如果后续有需要还可以从old文件夹里复制。

[icejean]

如果出版社要求PDF排版就要PDF编译通过，如果出版社要求Word排版那就可以只是Word编译通过。8-)