T2Net test

请问怎么测试呢？

Jan 19 '22 11:01 1632325673

选择验证结果为测试结果

发自我的iPhone

在 19.01.2022，12:33，1632325673 @.***> 写道：

请问怎么测试呢？

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Jan 19 '22 14:01 chunmeifeng

请问怎么测试呢？

AssertionError: Default process group is not initialized。您好，我在测试时出现了这个报错。请问一下代码部分具体要修改哪一部分才能进行测试呢？感谢！

Mar 24 '22 16:03 luoyu-buaa

作者您好，非常抱歉打扰到你，从您的论文中我学到了很多，我还有几个问题想向您请教一下：

1）github中说有提供.nii转为.mat的代码，请问可以从哪里获取呢

2）.h5文件运行convertH5tomat.py之后成的.mat文件是原来的130倍，只是单纯的数据复制还是用什么方法进行数据增广

3）.nii文件转为.mat文件后如何存入到.h5文件呢

作者方便提供数据处理转换的相关代码吗

------------------ 原始邮件 ------------------ 发件人: "chunmeifeng/T2Net" @.>; 发送时间: 2022年3月25日(星期五) 凌晨0:58 @.>; @.@.>; 主题: Re: [chunmeifeng/T2Net] test (Issue #6)

请问怎么测试呢？

AssertionError: Default process group is not initialized。您好，我在测试时出现了这个报错。请问一下代码部分具体要修改哪一部分才能进行测试呢？感谢！

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Apr 21 '22 02:04 1632325673

问题1是指的训练数据的预处理代码已经提供。问题2转成mat 之后应该是一个个的slice ，当然变多。问题3是在代码里有save ，将训练好的的图片存为h5文件，路径是你自己指定的当地路径。

发自我的iPhone

在 21.04.2022，04:59，1632325673 @.***> 写道：

作者您好，非常抱歉打扰到你，从您的论文中我学到了很多，我还有几个问题想向您请教一下：

1）github中说有提供.nii转为.mat的代码，请问可以从哪里获取呢

2）.h5文件运行convertH5tomat.py之后成的.mat文件是原来的130倍，只是单纯的数据复制还是用什么方法进行数据增广

3）.nii文件转为.mat文件后如何存入到.h5文件呢

作者方便提供数据处理转换的相关代码吗

------------------ 原始邮件 ------------------ 发件人: "chunmeifeng/T2Net" @.>; 发送时间: 2022年3月25日(星期五) 凌晨0:58 @.>; @.@.>; 主题: Re: [chunmeifeng/T2Net] test (Issue #6)

请问怎么测试呢？

AssertionError: Default process group is not initialized。您好，我在测试时出现了这个报错。请问一下代码部分具体要修改哪一部分才能进行测试呢？感谢！

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Apr 21 '22 09:04 chunmeifeng

作者你的数据预处理的思路是怎么样的，原始的IXI数据集格式为.nii.gz , 那作者您提供的.hdf5文件是把原始的.nii.gz文件存储进去的吗？还是把.nii.gz格式转为.mat格式后再存进.hdf5文件

------------------ 原始邮件 ------------------ 发件人: "chunmeifeng/T2Net" @.>; 发送时间: 2022年4月21日(星期四) 下午5:34 @.>; @.@.>; 主题: Re: [chunmeifeng/T2Net] test (Issue #6)

问题1是指的训练数据的预处理代码已经提供。问题2转成mat 之后应该是一个个的slice ，当然变多。问题3是在代码里有save ，将训练好的的图片存为h5文件，路径是你自己指定的当地路径。

发自我的iPhone

> 在 21.04.2022，04:59，1632325673 @.> 写道： >
> > 作者您好，非常抱歉打扰到你，从您的论文中我学到了很多，我还有几个问题想向您请教一下：
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> 1）github中说有提供.nii转为.mat的代码，请问可以从哪里获取呢
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> 2）.h5文件运行convertH5tomat.py之后成的.mat文件是原来的130倍，只是单纯的数据复制还是用什么方法进行数据增广
>
> 3）.nii文件转为.mat文件后如何存入到.h5文件呢
>
> 作者方便提供数据处理转换的相关代码吗
>
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> ------------------ 原始邮件 ------------------
> 发件人: "chunmeifeng/T2Net" @.>;
> 发送时间: 2022年3月25日(星期五) 凌晨0:58 > @.>;
> @.@.>;
> 主题: Re: [chunmeifeng/T2Net] test (Issue #6)
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> 请问怎么测试呢？
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Apr 21 '22 11:04 1632325673

代码读取的是mat文件，我将数据预处理成mat文件在重建完样本，存储下来的时候是保存的h5文件

1632325673 @.***> 于2022年4月21日周四 14:00写道：

作者你的数据预处理的思路是怎么样的，原始的IXI数据集格式为.nii.gz , 那作者您提供的.hdf5文件是把原始的.nii.gz文件存储进去的吗？还是把.nii.gz格式转为.mat格式后再存进.hdf5文件

------------------ 原始邮件 ------------------ 发件人: "chunmeifeng/T2Net" @.>; 发送时间: 2022年4月21日(星期四) 下午5:34 @.>; @.@.>; 主题: Re: [chunmeifeng/T2Net] test (Issue #6)

问题1是指的训练数据的预处理代码已经提供。问题2转成mat 之后应该是一个个的slice ，当然变多。问题3是在代码里有save ，将训练好的的图片存为h5文件，路径是你自己指定的当地路径。

发自我的iPhone

> 在 21.04.2022，04:59，1632325673 @.> 写道： > > > 作者您好，非常抱歉打扰到你，从您的论文中我学到了很多，我还有几个问题想向您请教一下： > > 1）github中说有提供.nii转为.mat的代码，请问可以从哪里获取呢 > > > > 2）.h5文件运行convertH5tomat.py之后成的.mat文件是原来的130倍，只是单纯的数据复制还是用什么方法进行数据增广 > > 3）.nii文件转为.mat文件后如何存入到.h5文件呢 > > 作者方便提供数据处理转换的相关代码吗 > > > > > ------------------ 原始邮件 ------------------ > 发件人: "chunmeifeng/T2Net" @.>; > 发送时间: 2022年3月25日(星期五) 凌晨0:58 > @.>; > @.@.>; > 主题: Re: [chunmeifeng/T2Net] test (Issue #6) > > > > > > > 请问怎么测试呢？ > > AssertionError: Default process group is not initialized。您好，我在测试时出现了这个报错。请问一下代码部分具体要修改哪一部分才能进行测试呢？感谢！ > > — > Reply to this email directly, view it on GitHub, or unsubscribe. > You are receiving this because you authored the thread.Message ID: @.> > — > Reply to this email directly, view it on GitHub, or unsubscribe. > You are receiving this because you commented.

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Apr 21 '22 12:04 chunmeifeng

那作者您能说一下您是怎么把数据预处理成.hdf5文件的吗，我想用别的数据集跑一下作者您的这个模型做实验对比数据

------------------ 原始邮件 ------------------ 发件人: "chunmeifeng/T2Net" @.>; 发送时间: 2022年4月21日(星期四) 晚上8:04 @.>; @.@.>; 主题: Re: [chunmeifeng/T2Net] test (Issue #6)

代码读取的是mat文件，我将数据预处理成mat文件在重建完样本，存储下来的时候是保存的h5文件

1632325673 @.***> 于2022年4月21日周四 14:00写道：

> 作者你的数据预处理的思路是怎么样的，原始的IXI数据集格式为.nii.gz , > 那作者您提供的.hdf5文件是把原始的.nii.gz文件存储进去的吗？还是把.nii.gz格式转为.mat格式后再存进.hdf5文件 > > > > ------------------ 原始邮件 ------------------ > 发件人: "chunmeifeng/T2Net" @.>; > 发送时间: 2022年4月21日(星期四) 下午5:34 > @.>; > @.@.>; > 主题: Re: [chunmeifeng/T2Net] test (Issue #6) > > > > > > 问题1是指的训练数据的预处理代码已经提供。 > 问题2转成mat 之后应该是一个个的slice ，当然变多。 > 问题3是在代码里有save ，将训练好的的图片存为h5文件，路径是你自己指定的当地路径。 > > 发自我的iPhone > > > 在 21.04.2022，04:59，1632325673 @.> 写道： > > > > > > 作者您好，非常抱歉打扰到你，从您的论文中我学到了很多，我还有几个问题想向您请教一下： > > > > 1）github中说有提供.nii转为.mat的代码，请问可以从哪里获取呢 > > > > > > > > 2）.h5文件运行convertH5tomat.py之后成的.mat文件是原来的130倍，只是单纯的数据复制还是用什么方法进行数据增广 > > > > 3）.nii文件转为.mat文件后如何存入到.h5文件呢 > > > > 作者方便提供数据处理转换的相关代码吗 > > > > > > > > > > ------------------ 原始邮件 ------------------ > > 发件人: "chunmeifeng/T2Net" @.&gt;; > > 发送时间:&nbsp;2022年3月25日(星期五) 凌晨0:58 > > @.&gt;; > > @.@.&gt;; > > 主题:&nbsp;Re: [chunmeifeng/T2Net] test (Issue #6) > > > > > > > > > > > > > > 请问怎么测试呢？ > > > > AssertionError: Default process group is not > initialized。您好，我在测试时出现了这个报错。请问一下代码部分具体要修改哪一部分才能进行测试呢？感谢！ > > > > — > > Reply to this email directly, view it on GitHub, or unsubscribe. > > You are receiving this because you authored the thread.Message ID: > @.&gt; > > — > > Reply to this email directly, view it on GitHub, or unsubscribe. > > You are receiving this because you commented. > > — > Reply to this email directly, view it on GitHub, or unsubscribe. > You are receiving this because you authored the thread.Message ID: > @.> > > — > Reply to this email directly, view it on GitHub > <https://github.com/chunmeifeng/T2Net/issues/6#issuecomment-1105112677>, > or unsubscribe > <https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AR75XN4UXES3UKMVO6LN2FLVGE7MVANCNFSM5MJVYJWA> > . > You are receiving this because you commented.Message ID: > @.> >

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Apr 21 '22 12:04 1632325673

我没有理解你的意思，代码的dataloader读取的就是mat文件，预处理成mat文件的代码已经提供了的

Apr 21 '22 12:04 chunmeifeng

我知道作者您提供了.hdf5文件和转换为.mat文件的代码。我是想问.hdf5文件是怎么从IXI数据集中的.nii.gz文件生成的

------------------ 原始邮件 ------------------ 发件人: "chunmeifeng/T2Net" @.>; 发送时间: 2022年4月21日(星期四) 晚上8:11 @.>; @.@.>; 主题: Re: [chunmeifeng/T2Net] test (Issue #6)

我没有理解你的意思，代码的dataloader读取的就是mat文件，预处理成mat文件的代码已经提供了的

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Apr 21 '22 12:04 1632325673

🔥 NEWS 🔥

We have upload the mask file.
Before our project, you need to transform the .nii file to .mat file at first.
We have provided the code of converting the .nii file to .mat file as well as the .mat data.

1632325673 @.***> 于2022年4月21日周四 14:32写道：

我知道作者您提供了.hdf5文件和转换为.mat文件的代码。我是想问.hdf5文件是怎么从IXI数据集中的.nii.gz文件生成的

------------------ 原始邮件 ------------------ 发件人: "chunmeifeng/T2Net" @.>; 发送时间: 2022年4月21日(星期四) 晚上8:11 @.>; @.@.>; 主题: Re: [chunmeifeng/T2Net] test (Issue #6)

我没有理解你的意思，代码的dataloader读取的就是mat文件，预处理成mat文件的代码已经提供了的

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Apr 21 '22 12:04 chunmeifeng

我知道作者您提供了.hdf5文件和转换为.mat文件的代码。我是想问.hdf5文件是怎么从IXI数据集中的.nii.gz文件生成的 … ------------------ 原始邮件 ------------------ 发件人: "chunmeifeng/T2Net" @.>; 发送时间: 2022年4月21日(星期四) 晚上8:11 @.>; @.@.>; 主题: Re: [chunmeifeng/T2Net] test (Issue #6) 我没有理解你的意思，代码的dataloader读取的就是mat文件，预处理成mat文件的代码已经提供了的 — Reply to this email directly, view it on GitHub, or unsubscribe. You are receiving this because you authored the thread.Message ID: @.***>

请问您找到方法把IXI数据集中的.nii.gz文件变成T2Net网络输入的hdf5文件了吗

Apr 08 '24 08:04 BoL0150

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