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issue 21
This is what I added. In cases of ambiguity (e.g. salt forms, protonation state) I prioritized based on label.
| subject | subject label | object | object label |
|---|---|---|---|
| ARO:0000013 | amikacin | CHEBI:2637 | amikacin |
| ARO:0000015 | methicillin | CHEBI:6827 | methicillin |
| ARO:0000018 | viomycin | CHEBI:15782 | viomycin |
| ARO:0000021 | ribostamycin | CHEBI:45257 | ribostamycin |
| ARO:0000023 | enoxacin | CHEBI:157175 | enoxacin |
| ARO:0000024 | butirosin | CHEBI:65109 | butirosin |
| ARO:0000025 | fosfomycin | CHEBI:28915 | fosfomycin |
| ARO:0000027 | roxithromycin | CHEBI:48844 | roxithromycin |
| ARO:0000028 | vancomycin | CHEBI:28001 | vancomycin |
| ARO:0000029 | teicoplanin | CHEBI:29687 | teicoplanin |
| ARO:0000030 | tigecycline | CHEBI:149836 | tigecycline |
| ARO:0000035 | sisomicin | CHEBI:9169 | sisomycin |
| ARO:0000036 | ciprofloxacin | CHEBI:100241 | ciprofloxacin |
| ARO:0000037 | apramycin | CHEBI:2790 | apramycin |
| ARO:0000039 | spectinomycin | CHEBI:9215 | spectinomycin |
| ARO:0000040 | streptomycin | CHEBI:17076 | streptomycin |
| ARO:0000043 | carbenicillin | CHEBI:3393 | carbenicillin |
| ARO:0000046 | lincomycin | CHEBI:6472 | lincomycin |
| ARO:0000047 | puromycin | CHEBI:17939 | puromycin |
| ARO:0000049 | kanamycin A | CHEBI:17630 | kanamycin A |
| ARO:0000051 | tetracycline | CHEBI:27902 | tetracycline |
| ARO:0000052 | tobramycin | CHEBI:28864 | tobramycin |
| ARO:0000055 | bicyclomycin | CHEBI:60584 | bicozamycin |
| ARO:0000056 | oxacillin | CHEBI:7809 | oxacillin |
| ARO:0000057 | telithromycin | CHEBI:29688 | telithromycin |
| ARO:0000058 | cefazolin | CHEBI:474053 | cefazolin |
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| ARO:0000062 | ceftriaxone | CHEBI:29007 | ceftriaxone |
| ARO:0000063 | cefuroxime | CHEBI:3515 | cefuroxime |
| ARO:0000065 | clarithromycin | CHEBI:3732 | clarithromycin |
| ARO:0000066 | clindamycin | CHEBI:3745 | clindamycin |
| ARO:0000068 | daptomycin | CHEBI:600103 | daptomycin |
| ARO:0000069 | doxycycline | CHEBI:50845 | doxycycline |
| ARO:0000070 | ertapenem | CHEBI:404903 | ertapenem |
| ARO:0000071 | levofloxacin | CHEBI:63598 | levofloxacin |
| ARO:0000072 | linezolid | CHEBI:63607 | linezolid |
| ARO:0000073 | meropenem | CHEBI:43968 | meropenem |
| ARO:0000074 | moxifloxacin | CHEBI:63611 | moxifloxacin |
| ARO:0000075 | nitrofurantoin | CHEBI:71415 | nitrofurantoin |
| ARO:0000078 | piperacillin | CHEBI:8232 | piperacillin |
| ARO:3000022 | ristocetin | CHEBI:85129 | ristocetin |
| ARO:3000111 | novobiocin | CHEBI:28368 | novobiocin |
| ARO:3000120 | balhimycin | CHEBI:47250 | BALHIMYCIN |
| ARO:3000132 | clorobiocin | CHEBI:47302 | clorobiocin |
| ARO:3000145 | tylosin | CHEBI:17658 | tylosin |
| ARO:3000150 | coumermycin A1 | CHEBI:3907 | coumermycin A1 |
| ARO:3000152 | minocycline | CHEBI:50694 | minocycline |
| ARO:3000158 | azithromycin | CHEBI:2955 | azithromycin |
| ARO:3000169 | rifampin | CHEBI:28077 | rifampicin |
| ARO:3000170 | imipenem | CHEBI:471744 | imipenem |
| ARO:3000176 | dirithromycin | CHEBI:474014 | dirithromycin |
| ARO:3000184 | chloroeremomycin | CHEBI:29556 | chloroeremomycin |
| ARO:3000188 | trimethoprim | CHEBI:45924 | trimethoprim |
| ARO:3000189 | oritavancin | CHEBI:82699 | oritavancin |
| ARO:3000200 | gramicidin S | CHEBI:5530 | gramicidin S |
| ARO:3000214 | hygromycin B | CHEBI:16976 | hygromycin B |
| ARO:3000222 | gramicidin A | CHEBI:80115 | Gramicidin A |
| ARO:3000223 | gramicidin B | CHEBI:188873 | Gramicidin B |
| ARO:3000227 | tyrothricin | CHEBI:201397 | Tyrothricin |
| ARO:3000269 | brodimoprim | CHEBI:131726 | brodimoprim |
| ARO:3000284 | tetroxoprim | CHEBI:135420 | tetroxoprim |
| ARO:3000324 | sulfadiazine | CHEBI:9328 | sulfadiazine |
| ARO:3000325 | sulfadimidine | CHEBI:102265 | sulfamethazine |
| ARO:3000327 | sulfadoxine | CHEBI:9329 | sulfadoxine |
| ARO:3000329 | sulfamethoxazole | CHEBI:9332 | sulfamethoxazole |
| ARO:3000330 | sulfisoxazole | CHEBI:102484 | sulfisoxazole |
| ARO:3000337 | iclaprim | CHEBI:131724 | iclaprim |
| ARO:3000382 | azidamfenicol | CHEBI:135238 | azidamfenicol |
| ARO:3000385 | chloramphenicol | CHEBI:17698 | chloramphenicol |
| ARO:3000456 | thiamphenicol | CHEBI:32215 | thiamphenicol |
| ARO:3000461 | florfenicol | CHEBI:87185 | florfenicol |
| ARO:3000466 | dalbavancin | CHEBI:82721 | dalbavancin |
| ARO:3000488 | telavancin | CHEBI:71229 | telavancin |
| ARO:3000497 | ethambutol | CHEBI:4877 | ethambutol |
| ARO:3000517 | rifaximin | CHEBI:75246 | rifaximin |
| ARO:3000528 | chlortetracycline | CHEBI:27644 | chlortetracycline |
| ARO:3000530 | rifabutin | CHEBI:45367 | rifabutin |
| ARO:3000534 | rifapentine | CHEBI:45304 | rifapentine |
| ARO:3000550 | aztreonam | CHEBI:161680 | aztreonam |
| ARO:3000552 | arsphenamine | CHEBI:9016 | arsphenamine |
| ARO:3000554 | mupirocin | CHEBI:7025 | mupirocin |
| ARO:3000583 | pristinamycin IA | CHEBI:8417 | pristinamycin IA |
| ARO:3000584 | quinupristin | CHEBI:8732 | Quinupristin |
| ARO:3000586 | pulvomycin | CHEBI:29668 | Pulvomycin |
| ARO:3000622 | colistin A | CHEBI:59064 | colistin A |
| ARO:3000624 | colistin B | CHEBI:59673 | colistin B |
| ARO:3000625 | polymyxin B1 | CHEBI:8309 | polymyxin B1 |
| ARO:3000626 | polymyxin B2 | CHEBI:59063 | polymyxin B2 |
| ARO:3000629 | bacitracin A | CHEBI:35862 | bacitracin A |
| ARO:3000631 | bacitracin F | CHEBI:221216 | Bacitracin F |
| ARO:3000632 | benzylpenicillin | CHEBI:18208 | benzylpenicillin |
| ARO:3000633 | phenoxymethylpenicillin | CHEBI:27446 | phenoxymethylpenicillin |
| ARO:3000634 | propicillin | CHEBI:52429 | propicillin |
| ARO:3000635 | dicloxacillin | CHEBI:4511 | dicloxacillin |
| ARO:3000636 | flucloxacillin | CHEBI:5098 | flucloxacillin |
| ARO:3000637 | ampicillin | CHEBI:28971 | ampicillin |
| ARO:3000638 | azlocillin | CHEBI:2956 | azlocillin |
| ARO:3000639 | mezlocillin | CHEBI:6919 | mezlocillin |
| ARO:3000640 | doripenem | CHEBI:135928 | doripenem |
| ARO:3000641 | cefalexin | CHEBI:3534 | cephalexin |
| ARO:3000642 | cefadroxil | CHEBI:3479 | cefadroxil |
| ARO:3000643 | cefotiam | CHEBI:355510 | cefotiam |
| ARO:3000644 | cefaclor | CHEBI:3478 | cefaclor |
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| ARO:3000646 | cefixime | CHEBI:472657 | cefixime |
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| ARO:3000648 | ceftibuten | CHEBI:3510 | ceftibuten |
| ARO:3000649 | cefditoren | CHEBI:59343 | cefditoren |
| ARO:3000650 | cefdinir | CHEBI:3485 | cefdinir |
| ARO:3000651 | ceftaroline | CHEBI:70729 | ceftaroline |
| ARO:3000652 | isepamicin | CHEBI:37951 | isepamicin |
| ARO:3000653 | G418 | CHEBI:42768 | geneticin |
| ARO:3000654 | arbekacin | CHEBI:37922 | arbekacin |
| ARO:3000655 | gentamicin B | CHEBI:198034 | Gentamicin B |
| ARO:3000657 | paromomycin | CHEBI:7934 | paromomycin |
| ARO:3000659 | gatifloxacin | CHEBI:5280 | gatifloxacin |
| ARO:3000660 | lomefloxacin | CHEBI:116278 | lomefloxacin |
| ARO:3000661 | nalidixic acid | CHEBI:100147 | nalidixic acid |
| ARO:3000662 | norfloxacin | CHEBI:100246 | norfloxacin |
| ARO:3000663 | ofloxacin | CHEBI:7731 | ofloxacin |
| ARO:3000664 | trovafloxacin | CHEBI:9763 | trovafloxacin |
| ARO:3000665 | grepafloxacin | CHEBI:5543 | Grepafloxacin |
| ARO:3000666 | sparfloxacin | CHEBI:9212 | sparfloxacin |
| ARO:3000667 | demeclocycline | CHEBI:4392 | demeclocycline |
| ARO:3000668 | oxytetracycline | CHEBI:27701 | oxytetracycline |
| ARO:3000669 | virginiamycin M1 | CHEBI:9997 | pristinamycin IIA |
| ARO:3000671 | tiamulin | CHEBI:44137 | tiamulin |
| ARO:3000672 | madumycin II | CHEBI:200095 | A2315A |
| ARO:3000673 | griseoviridin | CHEBI:199588 | Griseoviridin |
| ARO:3000674 | dalfopristin | CHEBI:4309 | dalfopristin |
| ARO:3000675 | pristinamycin IB | CHEBI:8418 | Pristinamycin IB |
| ARO:3000678 | pristinamycin IC | CHEBI:8419 | pristinamycin IC |
| ARO:3000683 | sulfacetamide | CHEBI:63845 | sulfacetamide |
| ARO:3000684 | mafenide | CHEBI:6633 | Mafenide |
| ARO:3000686 | thiostrepton | CHEBI:29693 | thiostrepton |
| ARO:3000688 | furazolidone | CHEBI:5195 | furazolidone |
| ARO:3000689 | metronidazole | CHEBI:6909 | metronidazole |
| ARO:3000691 | bleomycin A2 | CHEBI:3139 | bleomycin A2 |
| ARO:3000692 | bleomycin B2 | CHEBI:28641 | bleomycin B2 |
| ARO:3000693 | defensin | CHEBI:82761 | defensin |
| ARO:3000696 | Dactinomycin | CHEBI:27666 | actinomycin D |
| ARO:3000698 | sulfasalazine | CHEBI:9334 | sulfasalazine |
| ARO:3000699 | sulfamethizole | CHEBI:9331 | sulfamethizole |
| ARO:3000700 | lividomycin A | CHEBI:71961 | lividomycin A |
| ARO:3000701 | lividomycin B | CHEBI:71962 | lividomycin B |
| ARO:3000704 | cefalotin | CHEBI:124991 | cefalotin |
| ARO:3000758 | fosmidomycin | CHEBI:443725 | fosmidomycin |
| ARO:3000759 | fusidic acid | CHEBI:29013 | fusidic acid |
| ARO:3000761 | mecillinam | CHEBI:51208 | mecillinam |
| ARO:3000762 | pefloxacin | CHEBI:50199 | pefloxacin |
| ARO:3000867 | oleandomycin | CHEBI:16869 | oleandomycin |
| ARO:3000870 | triclosan | CHEBI:164200 | triclosan |
| ARO:3001220 | factumycin | CHEBI:216503 | FACTUMYCIN |
| ARO:3001221 | josamycin | CHEBI:31739 | josamycin |
| ARO:3001222 | chalcomycin | CHEBI:80016 | Chalcomycin |
| ARO:3001223 | midecamycin | CHEBI:31845 | Midecamycin |
| ARO:3001224 | mycinamicin | CHEBI:63276 | mycinamicin |
| ARO:3001226 | narbomycin | CHEBI:29649 | narbomycin |
| ARO:3001229 | rosaramicin | CHEBI:87084 | rosaramicin |
| ARO:3001230 | niddamycin | CHEBI:31908 | Niddamycin |
| ARO:3001231 | celesticetin | CHEBI:156421 | celesticetin |
| ARO:3001232 | methymycin | CHEBI:29630 | methymycin |
| ARO:3001233 | pikromycin | CHEBI:29665 | pikromycin |
| ARO:3001234 | kirromycin | CHEBI:190786 | Mocimycin |
| ARO:3001235 | aurodox | CHEBI:201478 | Aurodox |
| ARO:3001237 | GE2270A | CHEBI:29584 | GE2270A |
| ARO:3001246 | kirrothricin | CHEBI:223261 | Kirrothricin |
| ARO:3001249 | phenelfamycin A | CHEBI:222054 | Phenelfamycin A |
| ARO:3001250 | phenelfamycin B | CHEBI:222047 | Phenelfamycin B |
| ARO:3001251 | phenelfamycin C | CHEBI:222040 | Phenelfamycin C |
| ARO:3001253 | phenelfamycin E | CHEBI:222034 | Phenelfamycin E |
| ARO:3001256 | phenelfamycin F | CHEBI:222028 | Phenelfamycin F |
| ARO:3001257 | unphenelfamycin | CHEBI:222022 | Unphenelfamycin |
| ARO:3001260 | amythiamicin A | CHEBI:220214 | Amythiamicin A |
| ARO:3001296 | kasugamycin | CHEBI:81419 | kasugamycin |
| ARO:3001314 | retapamulin | CHEBI:166679 | Retapamulin |
| ARO:3001315 | valnemulin | CHEBI:29705 | Valnemulin |
| ARO:3001316 | azamulin | CHEBI:201468 | Azamulin |
| ARO:3001317 | pleuromutilin | CHEBI:8269 | Pleuromutilin |
| ARO:3001319 | fidaxomicin | CHEBI:68590 | fidaxomicin |
| ARO:3001322 | phenelfamycin G | CHEBI:203584 | Phenelfamycin G |
| ARO:3001323 | phenelfamycin H | CHEBI:225298 | Phenelfamycin H |
| ARO:3003241 | teixobactin | CHEBI:84192 | teixobactin |
| ARO:3003412 | dapsone | CHEBI:4325 | dapsone |
| ARO:3003474 | ethionamide | CHEBI:4885 | ethionamide |
| ARO:3003571 | magainin 1 | CHEBI:80186 | Magainin 1 |
| ARO:3003572 | magainin 2 | CHEBI:80190 | Magainin 2 |
| ARO:3003690 | sitafloxacin | CHEBI:4304 | Sitafloxacin |
| ARO:3003701 | rokitamycin | CHEBI:32103 | Rokitamycin |
| ARO:3003707 | faropenem | CHEBI:51788 | faropenem |
| ARO:3003708 | panipenem | CHEBI:7911 | Panipenem |
| ARO:3003780 | nybomycin | CHEBI:203472 | Nybomycin |
| ARO:3003823 | benzalkonium chloride | CHEBI:3020 | benzalkonium chloride |
| ARO:3003831 | temocillin | CHEBI:51817 | temocillin |
| ARO:3003832 | ticarcillin | CHEBI:9587 | ticarcillin |
| ARO:3003897 | tedizolid | CHEBI:82717 | tedizolid |
| ARO:3003898 | lugdunin | CHEBI:133127 | lugdunin |
| ARO:3003915 | Lysocin E | CHEBI:220095 | Lysocin E |
| ARO:3003927 | ceftolozane | CHEBI:134719 | ceftolozane |
| ARO:3003936 | Omadacycline | CHEBI:177758 | Omadacycline |
| ARO:3003951 | microcin J25 | CHEBI:203056 | Microcin J25 |
| ARO:3003957 | palmitic acid | CHEBI:15756 | hexadecanoic acid |
| ARO:3003958 | oleic acid | CHEBI:16196 | oleic acid |
| ARO:3004716 | Vanillobiocin | CHEBI:197618 | Vanillobiocin |
| ARO:3004717 | Isovanillobiocin | CHEBI:211429 | Isovanillobiocin |
| ARO:3004718 | Declovanillobiocin | CHEBI:206681 | Declovanillobiocin |
| ARO:3007093 | klebsidin | CHEBI:219023 | Klebsidin |
| ARO:3007114 | ornidazole | CHEBI:75176 | ornidazole |
| ARO:3007139 | cordycepin | CHEBI:29014 | cordycepin |
| ARO:3007143 | sulopenem | CHEBI:201412 | Sulopenem |
| ARO:3007165 | gemifloxacin | CHEBI:101853 | gemifloxacin |
| ARO:3007169 | pirlimycin | CHEBI:201427 | Pirlimycin |
| ARO:3007376 | gentamicin X | CHEBI:81280 | Gentamicin X2 |
| ARO:3007455 | cethromycin | CHEBI:29506 | cethromycin |
| ARO:3007468 | sulfanilamide | CHEBI:45373 | sulfanilamide |
| ARO:3007469 | sulfamerazine | CHEBI:102130 | sulfamerazine |
| ARO:3007471 | narasin | CHEBI:183815 | Narasin |
| ARO:3007472 | tilmicosin | CHEBI:195409 | tilmicosin |
| ARO:3007475 | cefcapene | CHEBI:131729 | cefcapene |
| ARO:3007481 | pseudouridimycin | CHEBI:199549 | Pseudouridimycin |
| ARO:3007485 | nigericin | CHEBI:7569 | nigericin |
| ARO:3007501 | caspofungin | CHEBI:474180 | caspofungin |
| ARO:3007502 | micafungin | CHEBI:600520 | micafungin |
| ARO:3007503 | anidulafungin | CHEBI:55346 | anidulafungin |
| ARO:3007504 | amphotericin B | CHEBI:2682 | amphotericin B |
| ARO:3007505 | nystatin | CHEBI:7660 | nystatin |
| ARO:3007506 | naftifine | CHEBI:7451 | naftifine |
| ARO:3007507 | terbinafine | CHEBI:9448 | terbinafine |
| ARO:3007508 | fluconazole | CHEBI:46081 | fluconazole |
| ARO:3007511 | itraconazole | CHEBI:6076 | itraconazole |
| ARO:3007512 | voriconazole | CHEBI:10023 | voriconazole |
| ARO:3007513 | posaconazole | CHEBI:64355 | posaconazole |
| ARO:3007514 | isavuconazole | CHEBI:85979 | isavuconazole |
| ARO:3007516 | clotrimazole | CHEBI:3764 | clotrimazole |
| ARO:3007517 | ketoconazole | CHEBI:47519 | ketoconazole |
| ARO:3007518 | miconazole | CHEBI:6923 | miconazole |
| ARO:3007519 | econazole | CHEBI:4754 | econazole |
| ARO:3007520 | oxiconazole | CHEBI:7825 | oxiconazole |
| ARO:3007521 | flumequine | CHEBI:85267 | flumequine |
| ARO:3007529 | pivmecillinam | CHEBI:51210 | pivmecillinam |
| ARO:3007534 | arsinothricin | CHEBI:220158 | Arsinothricin |
| ARO:3007541 | cyclomarin A | CHEBI:182606 | Cyclomarin A |
| ARO:3007542 | cyclomarin B | CHEBI:218852 | Cyclomarin B |
| ARO:3007543 | cyclomarin C | CHEBI:211272 | Cyclomarin C |
| ARO:3007547 | salinomycin | CHEBI:80025 | Salinomycin |
| ARO:3007570 | Mycaminosyltylonolide | CHEBI:77011 | 5-O-mycaminosyltylonolide |
| ARO:3007582 | formicamycin A | CHEBI:219437 | Formicamycin A |
| ARO:3007583 | formicamycin B | CHEBI:219443 | Formicamycin B |
| ARO:3007584 | formicamycin C | CHEBI:219450 | Formicamycin C |
| ARO:3007585 | formicamycin E | CHEBI:219460 | Formicamycin E |
| ARO:3007586 | formicamycin M | CHEBI:219506 | Formicamycin M |
| ARO:3007587 | formicamycin O | CHEBI:226636 | Formicamycin O |
| ARO:3007588 | formicamycin L | CHEBI:219500 | Formicamycin L |
| ARO:3007589 | formicamycin F | CHEBI:219466 | Formicamycin F |
| ARO:3007590 | formicamycin P | CHEBI:226642 | Formicamycin P |
| ARO:3007591 | formicamycin G | CHEBI:219470 | Formicamycin G |
| ARO:3007592 | formicamycin D | CHEBI:219455 | Formicamycin D |
| ARO:3007593 | formicamycin N | CHEBI:226631 | Formicamycin N |
| ARO:3007594 | formicamycin H | CHEBI:219476 | Formicamycin H |
| ARO:3007595 | formicamycin Q | CHEBI:226647 | Formicamycin Q |
| ARO:3007596 | formicamycin I | CHEBI:219484 | Formicamycin I |
| ARO:3007597 | formicamycin J | CHEBI:219490 | Formicamycin J |
| ARO:3007598 | formicamycin K | CHEBI:219496 | Formicamycin K |
| ARO:3007601 | cervimycin A | CHEBI:209712 | Cervimycin A |
| ARO:3007602 | cervimycin B | CHEBI:206185 | Cervimycin B |
| ARO:3007603 | cervimycin C | CHEBI:208953 | Cervimycin C |
| ARO:3007604 | cervimycin D | CHEBI:198705 | Cervimycin D |
| ARO:3007616 | pyrrolomycin A | CHEBI:156550 | pyrrolomycin A |
| ARO:3007617 | pyrrolomycin B | CHEBI:220052 | Pyrrolomycin B |
| ARO:3007618 | pyrrolomycin C | CHEBI:210117 | Pyrrolomycin C |
| ARO:3007620 | pyrrolomycin E | CHEBI:220086 | Pyrrolomycin E |
| ARO:3007624 | pyrrolomycin G | CHEBI:210960 | Pyrrolomycin G |
| ARO:3007625 | pyrrolomycin H | CHEBI:222702 | Pyrrolomycin H |
| ARO:3007627 | pyrrolomycin I | CHEBI:217964 | Pyrrolomycin I |
| ARO:3007766 | Marinomycin C | CHEBI:220588 | Marinomycin C |
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