作图如何根据pvalue来展示top，而不是p.adjust

[peiyu1223]

佬好，我想请教一下，由于我的差异基因数目有限，如果按照KEGG或GO富集默认展示作图，bar，tree等，都是根据p.adjust<0.05展示的，但是这样仅能展示少量的通路，如何按照pvalue<0.05展示top通路？我想展示尽可能多的通路。如果添加color=pvalue的话，他仅仅是展示p.adjust<0.05的那部分通路，并不会根据pvalue<0.05进行展示。谢谢

[huerqiang]

在你富集的时候选用合适的阈值就行。