pywt
pywt copied to clipboard
PyWavelets
`test_concurrent_cwt` failure on macOS arm64 with free-threaded CPython
We have a set of concurrent tests that use concurrent.futures.ThreadPoolExecutor. It has never failed before AFAIK; the tests also passed a number of times already with the new Linux free-threaded CI. It just now failed for the first time in the macOS arm64 free-threaded wheel build job (from the CI log):
_____________________________ test_concurrent_cwt ______________________________
@uses_futures
def test_concurrent_cwt():
atol = rtol = 1e-14
time, sst = pywt.data.nino()
dt = time[1]-time[0]
transform = partial(pywt.cwt, scales=np.arange(1, 4), wavelet='cmor1.5-1',
sampling_period=dt)
for _ in range(10):
arrs = [sst.copy() for _ in range(50)]
with futures.ThreadPoolExecutor(max_workers=max_workers) as ex:
> results = list(ex.map(transform, arrs))
...
../venv-test-arm64/lib/python3.13/site-packages/pywt/tests/test_concurrent.py:101:
_ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _
/Library/Frameworks/PythonT.framework/Versions/3.13/lib/python3.13/concurrent/futures/_base.py:619: in result_iterator
yield _result_or_cancel(fs.pop())
/Library/Frameworks/PythonT.framework/Versions/3.13/lib/python3.13/concurrent/futures/_base.py:317: in _result_or_cancel
return fut.result(timeout)
/Library/Frameworks/PythonT.framework/Versions/3.13/lib/python3.13/concurrent/futures/_base.py:456: in result
return self.__get_result()
/Library/Frameworks/PythonT.framework/Versions/3.13/lib/python3.13/concurrent/futures/_base.py:401: in __get_result
raise self._exception
/Library/Frameworks/PythonT.framework/Versions/3.13/lib/python3.13/concurrent/futures/thread.py:58: in run
result = self.fn(*self.args, **self.kwargs)
../venv-test-arm64/lib/python3.13/site-packages/pywt/_cwt.py:202: in cwt
frequencies = scale2frequency(wavelet, scales, precision)
../venv-test-arm64/lib/python3.13/site-packages/pywt/_functions.py:183: in scale2frequency
return central_frequency(wavelet, precision=precision) / scale
...
index = np.argmax(abs(fft(psi)[1:])) + 2
> if index > len(psi) / 2:
E TypeError: A loop/promoter has already been registered with 'greater' for (<class 'numpy.dtypes.Float64DType'>, <class 'numpy.dtypes.Float64DType'>, <class 'numpy.dtypes.BoolDType'>)
../venv-test-arm64/lib/python3.13/site-packages/pywt/_functions.py:156: TypeError
=========================== short test summary info ============================
FAILED tests/test_concurrent.py::test_concurrent_cwt - TypeError: A loop/promoter has already been registered with 'greater' for (<class 'numpy.dtypes.Float64DType'>, <class 'numpy.dtypes.Float64DType'>, <class 'numpy.dtypes.BoolDType'>)
================ 1 failed, 812 passed, 225 deselected in 4.72s =================
That looks like a missing lock around a cache in NumPy, which is probably already fixed by one of @ngoldbaum's PRs.
Some of the NumPy wheels at https://anaconda.org/scientific-python-nightly-wheels/numpy/files are 11 days old, which is due to gh-26810. So if the fix landed already in numpy's main branch, it may still not have propagated.
I'm able to reproduce random failures and seg faults on this test using the wheel. I think rebuilding it will make this test more stable.
That said, I do see a failure running a different test in the same file on the latest numpy main:
================================= test session starts ==================================
platform darwin -- Python 3.13.0b2, pytest-8.2.2, pluggy-1.5.0 -- /Users/goldbaum/.pyenv/versions/3.13.0b2-nogil/bin/python
cachedir: .pytest_cache
hypothesis profile 'default' -> database=DirectoryBasedExampleDatabase(PosixPath('/Users/goldbaum/Documents/pywt/.hypothesis/examples'))
rootdir: /Users/goldbaum/Documents/pywt
configfile: pytest.ini
plugins: hypothesis-6.103.1
collected 4 items
pywt/tests/test_concurrent.py::test_concurrent_swt PASSED [ 25%]
pywt/tests/test_concurrent.py::test_concurrent_wavedec PASSED [ 50%]
pywt/tests/test_concurrent.py::test_concurrent_dwt FAILED [ 75%]
pywt/tests/test_concurrent.py::test_concurrent_cwt PASSED [100%]
======================================= FAILURES =======================================
_________________________________ test_concurrent_dwt __________________________________
@uses_futures
def test_concurrent_dwt():
# dwt on 1D data calls the Cython dwt_single
# other cases call dwt_axis
for dwt_func, x in zip([pywt.dwt, pywt.dwt2, pywt.dwtn],
[np.ones(8), np.eye(16), np.eye(16)]):
transform = partial(dwt_func, wavelet='haar')
for _ in range(10):
arrs = [x.copy() for _ in range(100)]
with futures.ThreadPoolExecutor(max_workers=max_workers) as ex:
> results = list(ex.map(transform, arrs))
_ = 1
arrs = [array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.])]
dwt_func = <function dwt at 0x266bfcc05a0>
ex = <concurrent.futures.thread.ThreadPoolExecutor object at 0x266bfb95f10>
results = [(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.])),
(array([1.41421356, 1.41421356, 1.41421356, 1.41421356]),
array([0., 0., 0., 0.]))]
transform = functools.partial(<function dwt at 0x266bfcc05a0>, wavelet='haar')
x = array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.])
pywt/tests/test_concurrent.py:84:
_ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _
../../.pyenv/versions/3.13.0b2-nogil/lib/python3.13/concurrent/futures/_base.py:608: in map
fs = [self.submit(fn, *args) for args in zip(*iterables)]
chunksize = 1
fn = functools.partial(<function dwt at 0x266bfcc05a0>, wavelet='haar')
iterables = ([array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),
array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.])],)
self = <concurrent.futures.thread.ThreadPoolExecutor object at 0x266bfb95f10>
timeout = None
_ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _
self = <concurrent.futures.thread.ThreadPoolExecutor object at 0x266bfb95f10>
fn = functools.partial(<function dwt at 0x266bfcc05a0>, wavelet='haar')
args = (array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),), kwargs = {}
def submit(self, fn, /, *args, **kwargs):
> with self._shutdown_lock, _global_shutdown_lock:
E TypeError: descriptor '__enter__' for '_thread.RLock' objects doesn't apply to a '_thread.lock' object
args = (array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),)
fn = functools.partial(<function dwt at 0x266bfcc05a0>, wavelet='haar')
kwargs = {}
self = <concurrent.futures.thread.ThreadPoolExecutor object at 0x266bfb95f10>
../../.pyenv/versions/3.13.0b2-nogil/lib/python3.13/concurrent/futures/thread.py:165: TypeError
=============================== short test summary info ================================
FAILED pywt/tests/test_concurrent.py::test_concurrent_dwt - TypeError: descriptor '__enter__' for '_thread.RLock' objects doesn't apply to a '_thread.lock' object
============================= 1 failed, 3 passed in 0.39s ===================
No idea why this fails randomly (a few percent of the time on my M3 Mac) in this way.
Thanks for checking @ngoldbaum.
That second failure looks like a problem in either CPython or Cython:
self = <concurrent.futures.thread.ThreadPoolExecutor object at 0x266bfb95f10>
fn = functools.partial(<function dwt at 0x266bfcc05a0>, wavelet='haar')
args = (array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),), kwargs = {}
def submit(self, fn, /, *args, **kwargs):
> with self._shutdown_lock, _global_shutdown_lock:
E TypeError: descriptor '__enter__' for '_thread.RLock' objects doesn't apply to a '_thread.lock' object
args = (array([1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]),)
fn = functools.partial(<function dwt at 0x266bfcc05a0>, wavelet='haar')
kwargs = {}
self = <concurrent.futures.thread.ThreadPoolExecutor object at 0x266bfb95f10>
../../.pyenv/versions/3.13.0b2-nogil/lib/python3.13/concurrent/futures/thread.py:165: TypeError
=============================== short test summary info ================================
FAILED pywt/tests/test_concurrent.py::test_concurrent_dwt - TypeError: descriptor '__enter__' for '_thread.RLock' objects doesn't apply to a '_thread.lock' object
============================= 1 failed, 3 passed in 0.39s ===================
I can't find any existing bug report for this; _thread.RLock does have a ton of bug reports related to it not being pickle-able, but nothing is doing that in this test case.
I had a chat with @ambv over discord and he managed to find the upstream problem: https://github.com/python/cpython/issues/121368. Closing in favor of that since this is unrelated to pywavelets.
Except I don't have triage rights in this repo, so maybe @rgommers can do that.