Cálculo de R0 para Andalucía

[jajberni]

Lo primero, gracias por el código y el pedazo de análisis que te has currado. Creo que sería interesante incluir el número reproductivo básico (R0). Parece un buen indicador para ver cómo estamos evolucionando.

https://es.wikipedia.org/wiki/Ritmo_reproductivo_b%C3%A1sico

[Pakillo]

Gracias @jajberni !

Sí que estaría bien incluir el R0, pero apenas saco tiempo para extraer y limpiar los datos que ofrece la Junta... Si te animas, se aceptan pull requests! Creo que casi todos usan el paquete EpiEstim de R ;-) Pero me preocupa también que distintos grupos dan estimas de R bastante dispares (e.g. https://cnecovid.isciii.es/covid19/#declaraci%C3%B3n-agregada y https://ubidi.shinyapps.io/covid19/). Y sin ser un experto en epidemiología no me gustaría lanzar una nueva estima :)

Pensé simplemente scrapear la del Carlos III (https://cnecovid.isciii.es/covid19/#declaraci%C3%B3n-agregada) pero al ser un plotly interactivo no es muy straightforward... De la Junta no he visto ninguna estima oficial.

Mientras tanto, creo que los valores de confirmados PCR, hospitalizados y fallecimientos pueden servir para hacerse una idea de la evolución no?

P.S. Espero que todo bien por Córdoba!