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KEGG富集问题

Open BigCleverZ opened this issue 2 years ago • 10 comments

我用您包里的实例数据集Exp做KEGG image 这个代码跑KEGG富集的时候会出现 image 这个问题,不知道如何解决 用我自己的数据就会这样 image 麻烦您解答一下,谢谢

BigCleverZ avatar Apr 11 '23 16:04 BigCleverZ

我刚刚试了一下,并没有问题,你自己好好检查一下 1681290762560

junjunlab avatar Apr 12 '23 09:04 junjunlab

谢谢大佬,我再去试试

BigCleverZ avatar Apr 12 '23 09:04 BigCleverZ

俊哥,我最近也遇到了这个问题,我觉得应该是里面依赖的版本不同?

FLY-Fiancee avatar Apr 18 '23 02:04 FLY-Fiancee

谢谢大佬,我再去试试

请问,您解决了里面的报错了吗?

FLY-Fiancee avatar Apr 18 '23 02:04 FLY-Fiancee

谢谢大佬,我再去试试

请问,您解决了里面的报错了吗?

还是没有解决,BP、MF、CC都可以,一改成KEGG就报错

BigCleverZ avatar Apr 23 '23 07:04 BigCleverZ

可能是最近ClusterProfiler这个包发布了最新版,你如果不是最近第一次用这个包的话,更新一下这个包再跑试试~我最近也遇到更新了就好了

fangcaocao avatar May 20 '23 16:05 fangcaocao

可能是最近ClusterProfiler这个包发布了最新版,你如果不是最近第一次用这个包的话,更新一下这个包再跑试试~我最近也遇到更新了就好了

确实诶!我更新了最新版真的就可以了!谢谢大佬!

BigCleverZ avatar May 24 '23 15:05 BigCleverZ

谢谢大佬,我再去试试

请问,您解决了里面的报错了吗?

解决了,更新ClusterProfiler

BigCleverZ avatar May 24 '23 15:05 BigCleverZ

各位大佬好,为何我更新ClusterProfiler到clusterProfiler_4.6.2还是出现以上报错?求求各位大佬帮忙

Crick0509 avatar Oct 29 '23 14:10 Crick0509

各位大佬好,为何我更新ClusterProfiler到clusterProfiler_4.6.2还是出现以上报错?求求各位大佬帮忙 我刚开始也报错,clusterProfiler是4.6.2,需要手动加载种群数据库 library(org.Mm.eg.db) ,这样就好了

celiamtnez avatar Feb 12 '24 15:02 celiamtnez