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使用热图分簇后表达模式并不相近的问题

Open 2450942654 opened this issue 2 years ago • 1 comments

首先十分感谢大神的R包,为我这个小白刚开始的课题打下了第一步。 有一个小问题,就是当我加载我自己数据后使用语句 ck <- clusterData(exp = x, cluster.method = "kmeans", cluster.num = 10)
Rstudio会反馈给我一张分为10个簇的热图,这个时候的分簇信息看起来是正确的 但是当我使用语句 visCluster(object = ck, plot.type = "heatmap", column_names_rot = 45) Rstudio反馈给我的热图确实另一张分为10个簇的热图,而这张热图的聚类信息看起来是有问题的,因为他讲表达模式明显不同的基因也聚为一个簇。请问这是什么原因造成的呢? 谢谢!

2450942654 avatar Dec 03 '22 13:12 2450942654

在我更新R包后,问题已经解决!谢谢大神

2450942654 avatar Dec 03 '22 13:12 2450942654